Мы используем технологию cookie для понимания того, как вы пользуетесь нашим сайтом. Под этим подразумевается персонализированный контент и реклама. Для того, чтобы узнать больше - нажмите сюда. Пользуясь данным сайтом вы подтверждаете согласие с нашей политикой. Политика cookie.
Разделы Партнеры Информация LinkXpress
Вход
Реклама на сайте
Direct Effect Media/Illumina

Интегрированные анализы предоставляют молекулярную информацию о подтипах опухоли

Редакция HospiMedica - Россия
Опубликовано 30 Aug 2018
Print article
Гистопатология смешанной герминогенной опухоли яичек, демонстрирующая результат цитологического анализа высокозлокачественной опухоли, типичный для эмбриональной карциномы (фото любезно предоставлено Nephron).
Гистопатология смешанной герминогенной опухоли яичек, демонстрирующая результат цитологического анализа высокозлокачественной опухоли, типичный для эмбриональной карциномы (фото любезно предоставлено Nephron).
Самым распространенным злокачественным образованием у молодых взрослых мужчин европейского происхождения являются типы опухоли половых клеток яичка (ОПКЯ), полученные из неоплазии половых клеток in situ. Существуют два основных гистологических типа: чистая классическая семинома и несеминоматозные опухоли зародышевых клеток (НСОЗК).

Семинома часто имеет наиболее вялотекущую динамику, в то время как НСОЗК имеет тенденцию развиваться в более молодом возрасте и приводит к более высокой смертности. В настоящее время большой процент ОПКЯ хорошо поддается лечению, а общая относительная выживаемость мужчин с ОПКЯ превышает 95%; однако выжившие могут испытывать изнуряющие последствия лечения.

Многочисленная группа ученых, сотрудничающих с Университетом Северной Каролины в Чапел-Хилле (Чапел-Хилл, штат Северная Каролина, США), исследовала 137 первичных опухолей половых клеток яичка (ОПКЯ) с использованием высокоразмерных анализов геномных, эпигеномных, транскриптомных и протеомных признаков. Были рассмотрены пациенты в возрасте от 14 до 67 лет, средний возраст диагностируемых – 31 год. Гистология опухоли пациента классифицировалась в соответствии с консенсусом экспертов-патологов. Молекулярные и геномные данные собирали с использованием обращенно-фазных белковых матриц (ОФБМ), полноэкзомного секвенирования ДНК, секвенирования РНК, секвенирования микроРНК, матриц метилирования ДНК и массивов SNP для анализа числа копий.

Опираясь на эти молекулярные данные, команда сообщила, что, как и ожидалось, 72 семиномы в этом наборе группировались отдельно от несеминоматозных опухолей. Наблюдались относительно ограниченные частоты мутаций в большинстве гистологических подтипов. Всего три гена, KIT, KRAS и NRAS, подверглись существенным мутациям в ОПКЯ, и эти рецидивирующие мутации были ограничены подтипом семиномы. Внутри семином различия в метилировании ДНК и иммунной инфильтрации также, как правило, имеют тенденцию к совпадению при наличии либо отсутствии мутаций гена KIT. Тем не менее одна частота мутаций, плоидность, метилирование ДНК и/или экспрессия микроРНК соответствовали остальным несеминоматным подтипам.

В тератомах и опухолях желточного мешка группа наблюдала усиленную экспрессию микроРНК miR-375, которая обычно находится в малых количествах в образцах крови здоровых людей. С другой стороны, эмбрионные карциномы имели более высокую, чем обычно, экспрессию miR-19 и других микроРНК и были помечены метилированием ДНК на неканонических участках цитозина.

Авторы пришли к выводу, что новые молекулярные профили ОПКЯ позволили получить более полное представление о ранее сформулированных гипотезах, дать дополнительную информацию о механизмах онкогенеза ОПКЯ и определить возможные новые подходы к лечению ОПКЯ. Кэтрин Хоудли (Katherine Hoadley), доктор философии, ассистент-профессор, сотрудник Cancer Genetics и старший автор исследования, говорит: “Интеграция опухолевых характеристик и геномных и эпигеномных данных выявила характерные молекулярные ландшафты гистологических типов ОПКЯ и позволила установить ранее недооцененное разнообразие в семиномах”. Исследование было опубликовано 12 июня 2018 года в журнале Cell Reports.

Ссылки по теме:
University of North Carolina at Chapel Hill


Print article

Каналы

Химия

посмотреть канал
Новое исследование показывает, что ожирение, которое влияет на печень, может сыграть определенную роль в развитии болезни Альцгеймера и деменции в отдаленном будущем (фото предоставлено Deposit Photos).

На риск развития болезни Альцгеймера влияет состояние печени и диета

Сниженные уровни плазмалогенов имеют связь с повышенным риском болезни Альцгеймера. Плазмалогены вырабатываются в печени... Читать дальше

Молекулярная диагностика

посмотреть канал
Тромбоз глубоких вен (фото предоставлено Wikimedia Commons).

Предложен быстрый метод диагностирования тромбоза глубоких вен

Простой анализ крови был предложен в качестве альтернативы довольно дорогостоящей и интенсивной ультразвуковой процедуре... Читать дальше

Гематология

посмотреть канал
Мазок крови показывает гетерогенность размера периферических эритроцитов, известную как анизоцитоз (фото любезно предоставлено доктором медицины Джей Парк (Jay Park)).

Гематологические параметры прогнозируют тяжесть острого панкреатита

Острый панкреатит (ОП) - острое воспаление паренхимы поджелудочной железы, вызванное активированными ферментами поджелудочной... Читать дальше

Иммунология

посмотреть канал
Ревматоидный артрит может вызвать ряд изнуряющих симптомов, включая боль и отек в суставах, усталость и депрессию (фото любезно предоставлено SPL).

Генетические сигнатуры и биомаркеры предсказывают возникновение ревматоидного артрита

Ревматоидный артрит характеризуется воспалением суставов, приводящим к разрушению кости и хряща. Поскольку структурное повреждение... Читать дальше

Микробиология

посмотреть канал
HiSeq 2500 - мощная система с высокой пропускной способностью (фото любезно предоставлено Illumina).

American Gut Project сообщает о результатах работы по исследованию микробиома

Проведена большая работа, связанная с исследованием человеческого микробиома с конкретными фенотипами и переменными образа... Читать дальше

Лаб. технология

посмотреть канал
Гибридизация нуклеиновой кислоты на электрически реконфигурируемой сети из магнитных наночастиц с золотым покрытием позволяет обнаруживать микроРНК в крови (фото любезно предоставлено Университетом Нового Южного Уэльса).

Инструмент на основе магнитных наночастиц поможет обнаруживать микроРНК

Разработан метод на основе магнитных наночастиц для непосредственного обнаружения микроРНК в необработанных образцах цельной... Читать дальше

Индустрия

посмотреть канал
По прогнозам специалистов, глобальный рынок портативного коагулогического исследования будет расти частично благодаря растущему гериатрическому населению во всем мире (фото любезно предоставлено Shutterstock).

Глобальный рынок коагулогического исследования по месту лечения обусловлен увеличением численности гериатрического населения

По прогнозам специалистов, глобальный рынок портативного тестирования на коагуляцию будет расти с совокупными темпами годового... Читать дальше
Copyright © 2000-2018 Globetech Media. All rights reserved.