Мы используем технологию cookie для понимания того, как вы пользуетесь нашим сайтом. Под этим подразумевается персонализированный контент и реклама. Для того, чтобы узнать больше - нажмите сюда. Пользуясь данным сайтом вы подтверждаете согласие с нашей политикой. Политика cookie.
Please note that the LabMedica website is also available in a complete English version
Разделы Партнеры Информация LinkXpress
Вход
Реклама на сайте
SIGMA ALDRICH CORP.

Мобильное Приложение




Геномный анализ выявляет различия в подтипах рака печени

Редакция HospiMedica - Россия
Опубликовано 20 Jun 2019
Print article
На снимке: диаграмма геномного и транскриптомного профилирования комбинированной гепатоцеллюлярной и внутрипеченочной холангиокарциномы демонстрирует различные молекулярные подтипы (фото любезно предоставлено Пекинским университетом).
На снимке: диаграмма геномного и транскриптомного профилирования комбинированной гепатоцеллюлярной и внутрипеченочной холангиокарциномы демонстрирует различные молекулярные подтипы (фото любезно предоставлено Пекинским университетом).
Внутрипеченочная холангиокарцинома (ВХК) является вторым наиболее распространенным злокачественным новообразованием, возникающим в печени. ВХК составляет около 10% всех холангиокарцином. Она возникает из периферических желчных протоков в паренхиме печени, близко расположенных к ответвлениям желчевыводящей системы второго порядка.

Комбинированная гепатоцеллюлярная холангиокарцинома (кГЦК-ХК) является редким типом первичного рака печени, объединяющим гистопатологические признаки как гепатоцеллюлярной карциномы (ГЦК), так и холангиокарциномы (ХК). Из-за редкости и неоднозначных диагностических критериев заболевание по-прежнему остается плохо изученным и не имеет четко обозначенных вариантов лечения рецидивирующего или метастатического заболевания.

Многочисленная группа ученых совместно с коллегами Пекинского университета (Пекин, Китай) секвенировала геномы и транскриптомы 133 случаев кГЦК-ВХК, включая относящиеся к отдельным, комбинированным и смешанным подтипам кГЦК-ВХК. В паназиатском многоцентровом исследовании они проанализировали образцы кГЦК-ВХК с использованием комбинации секвенирования всего экзома, всего генома, РНК и выявления однонуклеотидных вариантов. На основании установленных критериев удалось классифицировать 121 из этих кГЦК-ВХК-случаев как отдельные, комбинированные или смешанные подтипы кГЦК-ВХК.

Среди всех рассмотренных образцов наиболее значимо мутировавшими генами были TP53, AXIN1 и RB1, при этом сигнальные пути, вовлеченные в модификацию гистонов и метилирование ДНК, претерпевали изменения главным образом в случае кГЦК-ВХК. Кроме того, было отмечено изменение некодирующих и структурных областей, включая изменения, влияющие на промотор TERT и гибридные гены, а также на фокально амплифицированные и исключенные участки. Ученые также сравнили мутационный ландшафт этих кГЦК-ВХК-образцов с аналогичным, выявленным в ГЦК и ВХК, и обнаружили, что TP53 мутировал почти в половине случаев кГЦК-ВХК, что значительно выше, чем в одних только ГЦК- или ВХК-опухолях, в то время как случаи кГЦК-ВХК имели более низкие показатели мутаций CTNNB1, по сравнению с ГЦК, и более низкие показатели мутаций KRAS, по сравнению с ВХК.

Ученые предположили, что предыдущая полемика о том, является ли кГЦК-ВХК отдельным типом рака печени, может быть обусловлена ранее изданной работой, в которой выборочно исследовался только один из этих подтипов кГЦК-ВХК, в некоторой степени напоминавший ВХК или ГЦК. Исследователи отметили, что как смешанные, так и комбинированные кГЦК-ВХК связаны с характеристикой стволовых клеток и имеют плохой прогноз. Оба типа имеют высокую экспрессию нестина, маркера бипотентной овальной клетки-предшественника, которая может придать раковым клеткам высокую клеточную пластичность. Когда сравнивались уровни нестина в различных подтипах кГЦК-ВХК с ГЦК и ВХК, обнаружилось, что более 80% образцов кГЦК-ВХК имели более высокие уровни нестина, чем образцы с ГЦК или ВХК. Это говорит о том, что нестин может служить биомаркером для диагностики кГЦК-ВХК. Исследование было опубликовано 23 мая 2019 года в журнале Cancer Cell.

Ссылки по теме:
Peking University


Print article

Каналы

Химия

посмотреть канал
В новом исследовании предполагается, что пациенты с подагрой имеют повышенный риск развития хронической болезни почек (фото любезно предоставлено Shutterstock).

Подагра повышает риск прогрессирования хронической болезни почек

Хроническая болезнь почек (ХБП) является заболеванием, носящим эпидемический характер, и одной из основных проблем общественного... Читать дальше

Гематология

посмотреть канал
Жертвы с серьезными травмами, которые получают переливания единиц эритроцитарной массы, хранящихся в течение 22 дней или больше, могут столкнуться с повышенным риском смерти в течение 24 часов (фото любезно предоставлено службой патологии юго-западного Лондона /South West London Pathology/).

Переливание крови, бывшей длительное время на хранении, связано с неблагоприятными явлениями

Ведущей причиной смерти после тяжелой травмы является потеря крови. Жертвы с серьезными травмами, которые получают переливания... Читать дальше

Иммунология

посмотреть канал
Химический анализатор RX Daytona – компактный, полностью автоматизированный настольный клинический химический анализатор, идеально подходящий для лабораторий с малой и средней пропускной способностью (фото любезно предоставлено Randox Laboratories).

Мочевые биомаркеры позволяют диагностировать серьезные аллергические реакции почек

Острый интерстициальный нефрит (ОИН) представляет собой состояние, характеризующееся воспалением и отеком почечных канальцев... Читать дальше

Микробиология

посмотреть канал
Alere q - это полностью автоматизированная платформа для тестирования нуклеиновых кислот, которая позволяет использовать молекулярное тестирование для диагностики в любых медицинских условиях (фото любезно предоставлено Alere Technologies).

Экспресс-анализ выявляет устойчивый к пиразинамиду туберкулез

Туберкулез (ТБ), вызываемый штаммами микобактерии туберкулезного комплекса (Mycobacterium tuberculosis complex - MTBC), остается... Читать дальше

Лаб. технология

посмотреть канал
(A) и (B) – микрофотографии слоев устройства; (C) – пресс-форма, готовая к разливке, и (D) – чип, установленный на предметном стекле. Фото любезно предоставлено Государственным университетом Сан-Диего.

Микрофлюидное устройство изолирует кластеры циркулирующих опухолевых клеток

Тремя основными проблемами при лечении рака являются метастазы, рецидивы и приобретенная резистентность к терапии.... Читать дальше

Патология

посмотреть канал
Ученые объединили многофотонную микроскопию с автоматизированными алгоритмами получения изображений и статистического анализа, чтобы различить здоровые и больные ткани. На этом изображении, полученном полностью без меток, неинвазивным способом, коллаген окрашен в зеленый цвет, а кластеры метастатических клеток яичников представлены в красном цвете (фото любезно предоставлено Университетом Тафтса).

Неинвазивные способы визуализации выявляют рак на молекулярном уровне

Для больных раком наличие метастазов требует установления стадии, которая, в свою очередь, определяет соответствующий выбранный... Читать дальше

Индустрия

посмотреть канал
По прогнозам специалистов, мировой рынок диагностики in vitro будет расти в период между 2017 и 2025 годами и к концу 2025 года достигнет почти 90 миллиардов долларов США (фото любезно предоставлено iStock).

К 2025 году мировой рынок диагностики in vitro достигнет 89 миллиардов долларов США

Мировой рынок диагностики in vitro был оценен в 55,00 миллиардов долларов США в 2016 году и, согласно прогнозам, будет расти... Читать дальше
Copyright © 2000-2019 Globetech Media. All rights reserved.