Мы используем технологию cookie для понимания того, как вы пользуетесь нашим сайтом. Под этим подразумевается персонализированный контент и реклама. Для того, чтобы узнать больше - нажмите сюда. Пользуясь данным сайтом вы подтверждаете согласие с нашей политикой. Политика cookie.
Разделы Партнеры Информация LinkXpress
Вход
Реклама на сайте
Direct Effect Media/Illumina

РНК-секвенирование образца со слизистой оболочки носа поможет диагностировать астму

Редакция HospiMedica - Россия
Опубликовано 10 Aug 2018
Print article
Пневмотахометры, используемые для измерения максимальной скорости выдоха при контроле и диагностике астмы (фото предоставлено Wikimedia Commons).
Пневмотахометры, используемые для измерения максимальной скорости выдоха при контроле и диагностике астмы (фото предоставлено Wikimedia Commons).

Создана ​​панель биомаркеров из 90 генов, которая позволяет быстро и точно диагностировать астму на основе простых образцов, взятых с помощью назальной щеточки.

Носовой биомаркер астмы представляет большой интерес, учитывая отсутствие сложностей при осмотре и общую биологию дыхательных путей между верхним и нижним путями. Носовые проходы легко доступны для врача, непосредственно связаны с легкими и подвергаются воздействию общих факторов окружающей среды.

В связи с этим исследователи из Медицинской школы Икана в центре Маунт-Синай (Icahn School of Medicine at Mount Sinai, Нью-Йорк, штат Нью-Йорк, США) поставили цель выявить классификатор легкой и умеренной астмы на основе исследований носа. Для этого у 190 испытуемых с легкой и умеренной астмой и у контрольной группы с помощью назальной щеточки были взяты образцы из носа для последующего секвенированиея РНК из этих образцов.

Исследователи использовали секвенирование РНК (RNAseq) для получения полного профиля экспрессии гена из соскобов со слизистой оболочки носа, собранных у пациентов с легкой и умеренной астмой и контрольной группы, создав самый большой набор данных назальной RNAseq при астме на сегодняшний день. Они сфокусировали внимание на легкой и умеренной астме, потому что природа болезни с периодическими улучшениями и ухудшениями состояния нетяжелой астмы делает ее относительно сложной для диагностики.

Используя надежный конвейер, основанный на механизме обучения, состоящий из выбора функций, классификации и статистического анализа, исследователи определили классификатор астмы на 90 генов, который точно проводит различие между субъектами с астмой легкой и средней степени тяжести на основе носовых соскобов. Они оценили эффективность такого классификатора астмы на восьми испытательных наборах от независимых субъектов с астмой и другими респираторными заболеваниями, обнаружив, что анализы выполняются с высокой точностью, чувствительностью и специфичностью к астме.

“Легкую и умеренную астму бывает трудно диагностировать, потому что симптомы со временем меняются и могут быть осложнены другими респираторными заболеваниями, — говорит старший автор доктор Субинда Буняванич (Supinda Bunyavanich), сотрудник Медицинской школы Икана в Маунт-Синай. — Чтобы взять соскобы со слизистой оболочки носа требуется несколько секунд. Когда у врачей время ограничено, особенно это касается работников по оказанию первичной медико-санитарной помощи при первичной диагностике астмы, есть возможность значительно улучшить результаты лечения пациентов за счет постановки раннего и точного диагноза. При валидации в больших когортах наш биомаркер астмы может привести к разработке минимально инвазивного теста для помощи при диагностике астмы на передовой линии оказания помощи, где время и ресурсы часто не позволяют выполнить анализ функции легких”.

Исследование биомаркеров астмы было опубликовано в онлайн-издании журнала Scientific Reports от 11 июня 2018 года.

Ссылки по теме:
Icahn School of Medicine at Mount Sinai



Print article

Каналы

Химия

посмотреть канал
Новое исследование показывает, что ожирение, которое влияет на печень, может сыграть определенную роль в развитии болезни Альцгеймера и деменции в отдаленном будущем (фото предоставлено Deposit Photos).

На риск развития болезни Альцгеймера влияет состояние печени и диета

Сниженные уровни плазмалогенов имеют связь с повышенным риском болезни Альцгеймера. Плазмалогены вырабатываются в печени... Читать дальше

Гематология

посмотреть канал
Мазок крови показывает гетерогенность размера периферических эритроцитов, известную как анизоцитоз (фото любезно предоставлено доктором медицины Джей Парк (Jay Park)).

Гематологические параметры прогнозируют тяжесть острого панкреатита

Острый панкреатит (ОП) - острое воспаление паренхимы поджелудочной железы, вызванное активированными ферментами поджелудочной... Читать дальше

Иммунология

посмотреть канал
Ревматоидный артрит может вызвать ряд изнуряющих симптомов, включая боль и отек в суставах, усталость и депрессию (фото любезно предоставлено SPL).

Генетические сигнатуры и биомаркеры предсказывают возникновение ревматоидного артрита

Ревматоидный артрит характеризуется воспалением суставов, приводящим к разрушению кости и хряща. Поскольку структурное повреждение... Читать дальше

Микробиология

посмотреть канал
HiSeq 2500 - мощная система с высокой пропускной способностью (фото любезно предоставлено Illumina).

American Gut Project сообщает о результатах работы по исследованию микробиома

Проведена большая работа, связанная с исследованием человеческого микробиома с конкретными фенотипами и переменными образа... Читать дальше

Патология

посмотреть канал
Набор для обратной транскрипции Sensiscript, использующий очень небольшое количество РНК, идеально подходит для случаев применения, требующих высокой чувствительности (фото любезно предоставлено Qiagen).

Определен новый белок-мишень для выявления рака толстой кишки

Колоректальный рак (КРР) является третьим наиболее часто диагностируемым онкологическим заболеванием и третьей ведущей причиной... Читать дальше

Лаб. технология

посмотреть канал
Гибридизация нуклеиновой кислоты на электрически реконфигурируемой сети из магнитных наночастиц с золотым покрытием позволяет обнаруживать микроРНК в крови (фото любезно предоставлено Университетом Нового Южного Уэльса).

Инструмент на основе магнитных наночастиц поможет обнаруживать микроРНК

Разработан метод на основе магнитных наночастиц для непосредственного обнаружения микроРНК в необработанных образцах цельной... Читать дальше

Индустрия

посмотреть канал
По прогнозам специалистов, глобальный рынок портативного коагулогического исследования будет расти частично благодаря растущему гериатрическому населению во всем мире (фото любезно предоставлено Shutterstock).

Глобальный рынок коагулогического исследования по месту лечения обусловлен увеличением численности гериатрического населения

По прогнозам специалистов, глобальный рынок портативного тестирования на коагуляцию будет расти с совокупными темпами годового... Читать дальше
Copyright © 2000-2018 Globetech Media. All rights reserved.