Мы используем технологию cookie для понимания того, как вы пользуетесь нашим сайтом. Под этим подразумевается персонализированный контент и реклама. Для того, чтобы узнать больше - нажмите сюда. Пользуясь данным сайтом вы подтверждаете согласие с нашей политикой. Политика cookie.
Разделы Партнеры Информация LinkXpress
Вход
Реклама на сайте
Direct Effect Media/Illumina

BIO-RAD LABORATORIES

Provides full range of instrumentation, reagent kits, software and quality control systems to clinical laboratories. ... читать дальше Продукция: Больше продуктов

Анализ циркулирующей ДНК выявляет раковые мутации

Редакция HospiMedica - Россия
Опубликовано 25 Sep 2017
Print article
Считыватель капель QX200 Droplet для EvaGreen или применений цифровой зондовой PCR для использования с цифровой системой QC200 Droplet (фото предоставлено лабораториями Bio-Rad Laboratories).
Считыватель капель QX200 Droplet для EvaGreen или применений цифровой зондовой PCR для использования с цифровой системой QC200 Droplet (фото предоставлено лабораториями Bio-Rad Laboratories).
У раковых пациентов апоптотические и некротические опухолевые клетки высвобождают фрагменты своей ДНК в кровь. Такие ДНК обычно называют циркулирующей опухолевой ДНК (ctDNA), и они могут быть использованы для секвенирования ДНК или анализов молекулярного генотипирования для идентификации и количественного измерения молекул ctDNA, несущих соматические мутации.

Анализ с помощью одноцветной цифровой полимеразной цепной реакции (ПЦР) дает несколько преимуществ перед другими методами анализа циркулирующей опухолевой ДНК, по сравнению с направленным секвенированием следующего поколения и цифровыми ПЦР-анализами на основе флуоресцентного зонда. Главное преимущество заключается в том, что новый метод не полагается на предварительную амплификацию, которая может приводить к ошибкам и искажениям.

Ученые из Стэнфордского университета (Пало-Альто, Калифорния) получили образцы крови от пациентов, которым было сделано секвенирование гена диагностируемого рака их колоректальной аденокарциномы или холангиокарциномы и у которых имелись диагностические отчеты о мутации рака, доступные во время регистрации участников исследования. Команда использовала одноцветный цифровой ПЦР-анализ, который выявляет и количественно определяет мутации рака непосредственно из циркулирующей ДНК, собранной из плазмы больных раком. В основе этого подхода лежит использование красителя интеркалятора двухцепочечной ДНК и парных наборов ДНК-праймеров, специфичных для аллелей, для определения абсолютного количества мутаций и молекул ДНК, содержащих аллели дикого типа, присутствующие в образце.

Перед проведением цифровой капельной ПЦР (ddPCR) клеточные линии и фиксированные в формалине и залитые парафином (FFPE) образцы, содержащие геномную ДНК, были обработаны с помощью фрагментов рестриктазы EcoRI и подверглись дальнейшей обработке. ДНК, свободная от клеток пациента, не требовала ферментативной фрагментации, учитывая, что эти образцы уже сильно фрагментированы. Все процессы ddPCR были выполнены с использованием системы и протокола Bio-Rad EvaGreen QX200 ddPCR. После термического циклирования пластину переносили и считывали с помощью устройства Bio-Rad QX200.

В анализе бесклеточной ДНК в качестве входных данных используется 1 нг неамплифицированной ДНК, что составляет приблизительно 300 геномных эквивалентов, при этом существует молекулярный предел обнаружения трех мутантных эквивалентных по геному молекул ДНК для каждой аналитической реакции. После генерации индивидуализированных тестов на определение мутаций исследователи смогли идентифицировать циркулирующую опухолевую ДНК у трех из шести пациентов. У одного пациента анализ смог показать наличие трех различных мутаций. Для трех пациентов, у которых образцы не показали повышенные уровни раковой ДНК, во время сбора материала проводилось активное лечение.

Ханли П. Джи (Hanlee P. Ji), доктор медицины, адъюнкт-профессор и ведущий исследователь, говорит: “Молекулярные тесты, подобные тем, которые мы разработали, позволят пациентам проверять их состояние при каждом посещении и, следовательно, имеют потенциал для быстрого отслеживания роста и распространения рака. Более того, быстрый период реализации теста и относительно низкая стоимость, особенно по сравнению с секвенированием ДНК следующего поколения, предоставляют потенциальную возможность для универсального мониторинга большего числа пациентов, чем в настоящее время”. Исследование было опубликовано 14 августа 2017 года в The Journal of Molecular Diagnostics.




Print article

Каналы

Химия

посмотреть канал
Реагент Access AccuTnI+3 содержит парамагнитные частицы для хемилюминесцентного иммуноанализа для количественного определения уровней сердечного тропонина I (cTnI) в сыворотке и плазме человека с использованием системы иммуноанализа Access 2 Immunoassay System для оказания помощи в диагностике инфаркта миокарда (фото любезно предоставлено Beckman-Coulter).

Анализ крови предсказывает риск смерти от коронарной недостаточности

Сердечно-сосудистое (СС) заболевание связано с активацией ренин-ангиотензиновой системы (РАС) и является основной причиной... Читать дальше

Гематология

посмотреть канал
Набор для сбора крови BD Vacutainer UltraTouch (фото любезно предоставлено Becton Dickinson).

Новое устройство способствует положительному опыту проведения флеботомии

Флеботомия является необходимой процедурой, но может быть источником боли, стресса и тревоги для некоторых пациентов.... Читать дальше

Иммунология

посмотреть канал
Orientia tsutsugamushi (стрелки) в культуре жидкости бронхоальвеолярного лаважа у пациента с острым респираторным дистресс-синдромом (фото любезно предоставлено Университетом Экс-Марсель).

Антитела могут быть интерпретированы после заражения болезнью цуцугамуши

Цуцугамуши (scrub typhus) представляет собой зоонозную инфекцию, вызываемую бактерией Orientia tsutsugamushi.... Читать дальше

Микробиология

посмотреть канал
Компьютерное изображение E. coli (фото любезно предоставлено Алисой Эккерт (Alissa Eckert) и Дженнифер Остхуйзен (Jennifer Oosthuizen)/Центр по контролю и профилактике заболеваний).

Обнаружена взаимосвязь группы крови с тяжестью диареи

Энтеротоксигенные бактерии кишечной палочки (Escherichia coli) ежегодно становятся виновниками миллионов случаев диареи и... Читать дальше

Патология

посмотреть канал
Гистопатология папиллярного мышечно-неинвазивного рака мочевого пузыря (фото любезно предоставлено Американской урологической ассоциацией (American Urological Association)).

Простой анализ может снизить нагрузку лечения рака мочевого пузыря

Рак мочевого пузыря – достаточно распространенное заболевание, налагающее самую высокую цену на пациента в системе здравоохранения... Читать дальше

Лаб. технология

посмотреть канал
Обнаружение вируса Зика с использованием платиновых наномоторов и мобильного телефона (фото предоставлено Женской больницей Бригама)

Тестирование с использованием мобильного телефона поможет быстро выявлять вирус Зика

Вирус Зика, который вызывает микроцефалию и другие неврологические осложнения у младенцев, чьи матери были инфицированы во... Читать дальше

Индустрия

посмотреть канал
По прогнозам специалистов, глобальный рынок товаров для ПЦР к 2025 году превысит 7,4 миллиарда долларов США (фото любезно предоставлено iStock).

Глобальный рынок ПЦР к 2025 году превысит 7 миллиардов долларов США

Глобальный рынок товаров для полимеразной цепной реакции (ПЦР) в 2017 году оценивался в 3,7 миллиарда долларов США и, согласно... Читать дальше
Copyright © 2000-2018 Globetech Media. All rights reserved.