Разделы Партнеры Информация LinkXpress
Вход
Реклама на сайте
SIGMA ALDRICH CORP.

Тестовые маркеры идентифицируют опухолевую ДНК и определяют местонахождение опухоли

Редакция HospiMedica - Россия
Опубликовано 13 Jul 2017
Print article
Биоинженеры из Калифорнийского университета в Сан-Диего разработали новый анализ крови, который может обнаружить рак и определить, где в организме растет опухоль (фото любезно предоставлено iStock).
Биоинженеры из Калифорнийского университета в Сан-Диего разработали новый анализ крови, который может обнаружить рак и определить, где в организме растет опухоль (фото любезно предоставлено iStock).
Группа молекулярных генетиков разработала диагностический инструмент, который идентифицирует циркулирующую опухолевую ДНК и определяет орган, в котором находится опухоль.

Исследователи из Калифорнийского университета в Сан-Диего (University of California San Diego) основали свой метод на наличии в геноме блоков метилированных гаплотипов. Гаплотип представляет собой набор однонуклеотидных полиморфизмов на одной хромосоме, которые склонны статистически всегда встречаться вместе. Считается, что идентификация этих статистических ассоциаций и нескольких аллелей определенной последовательности гаплотипов может облегчить идентификацию всех других подобных полиморфных сайтов, находящихся поблизости на хромосоме.

Исследователи акцентировали внимание на систематическом поиске и исследовании участков в полном геноме человека, которые показали высококоординированное метилирование. Они определили 147 888 блоков метилированного гаплотипа плотно связанных сайтов CpG. CpG-сайты представляют собой участки ДНК, где за нуклеотидом цитозина следует гуаниновый нуклеотид в линейной последовательности оснований в направлении 5'-3' вдоль. CpG является сокращением для 5'-C-phosphate-G-3', то есть цитозин и гуанин, разделенные только одним фосфатом; фосфат связывает любые два нуклеозида вместе в ДНК. Каждая ткань в организме может быть идентифицирована уникальной сигнатурой метилированных гаплотипов.

Используя данные метилированных гаплотипов, исследователи составили базу данных полных образцов метилирования CpG из 10 различных нормальных тканей (печень, кишечник, толстая кишка, легкие, мозг, почка, поджелудочная железа, селезенка, желудок и кровь). Затем они проанализировали образцы опухоли и крови от больных раком, чтобы собрать базу данных генетических онкомаркеров. Используя эту базу данных, исследователи продемонстрировали количественную оценку опухолевой нагрузки и картирования исходной ткани в циркулирующей бесклеточной ДНК 59 пациентов с раком легкого или колоректальным раком.

"Знание расположения опухоли важно для эффективного раннего выявления, — заявил старший научный сотрудник доктор Кун Чжан (Kun Zhang), профессор биоинженерии в Калифорнийском университете в Сан-Диего. — Это доказательство концепции. Чтобы перенести это исследование на клиническую стадию, нам необходимо сотрудничество с онкологами для дальнейшей оптимизации и усовершенствования этого метода".

"Мы сделали это открытие случайно. Вначале мы применяли традиционный подход и просто искали сигналы раковых клеток и пытались выяснить, откуда они пришли. Однако мы также заметили сигналы от других клеток и поняли, что если мы интегрируем оба набора сигналов вместе, мы могли бы фактически определить наличие или отсутствие опухоли и места, где опухоль растет", — сказал доктор Чжан.

Этот метод был детально описан 6 марта 2017 года в онлайн-версии журнала Nature Genetics.


Print article
ELITech Group

Каналы

Химия

посмотреть канал
Масс-спектрометр высокого разрешения Synapt G2 (HDMS). Фото предоставлено Waters.

Метаболический анализ был применен для исследования мукополисахаридоза

Наследственные нарушения обмена веществ (ННОВ) представляют собой группу из примерно 500 редких заболеваний с общей оценкой... Читать дальше

Гематология

посмотреть канал
Автоматизированный гематологический анализатор KX-21 N (фото любезно предоставлено компанией Sysmex).

Проведено сравнение биомаркеров серповидных эритроцитов и гемоглобина, входящего в состав серповидных эритроцитов

Серповидно-клеточная болезнь представляет собой группу наследственных заболеваний, которая включает серповидно-клеточную анемию.... Читать дальше

Иммунология

посмотреть канал
Микрофотография, показывающая инфильтрационные опухолевые лимфоциты при колоректальной карциноме. Окрашивание гематоксилином и эозином. Инфильтрационные опухолевые лимфоциты (ИОЛ) указывают на микросателлитную нестабильность (фото любезно предоставлено Wikimedia).

Микроокружение опухолей может предоставить биомаркер для женщин с трижды негативным раком молочной железы

Исследователи обнаружили, что присутствие инфильтрирующих опухолей лимфоцитов (ИОЛ) значительно варьировалось в опухолях... Читать дальше

Микробиология

посмотреть канал
Бета-гемолитические колонии различаются в агаровых культурах с альфа-гемолитическим стрептококком пневмонии. (A) Флуоресцентные и яркие изображения чистых и смешанных бактериальных колоний в агаре BHI с L-Hoechst (фото любезно предоставлено Биологической лабораторией Temasek).

Липидные везикулы заменяют кровь в новом бактериальном тесте

Бета-гемолитические бактерии – это патогены, которые часто виновны в болезнях, встречающихся среди школьников.... Читать дальше

Патология

посмотреть канал
Микрофотография, показывающая бластомицеты, окрашенные реактивом Шиффа (Periodic Acid Schiff, PAS). Обратите внимание на зарождающийся микроорганизм (стрелка) и лежащую в основе пиогранулематозную воспалительную реакцию на заднем плане (фото любезно предоставлено Университетом Алабамы в Бирмингеме).

Пациенты с ослабленным иммунитетом имеют риск развития бластомикоза

Большинство инвазивных грибковых инфекций у пациентов с ослабленным иммунитетом вызываются Zygomycetes, Aspergillus и Candida,... Читать дальше

Лаб. технология

посмотреть канал
Бумажное диагностическое устройство, которое обнаруживает биомаркеры и идентифицирует болезни путем проведения электрохимических анализов. Тесты меняют цвет, демонстрируя определенные результаты. Устройство можно подключить к портативному потенциостату, показанному слева (фото любезно предоставлено Университетом Пердью, Аникет Паль (Aniket Pal)).

Одноразовое портативное устройство поможет проводить исследования в районах с недостаточным доступом к ресурсам

В недавно опубликованной статье описывается новое диагностическое устройство, изготовленное из различных типов бумаги, которое... Читать дальше

Индустрия

посмотреть канал
Прогнозы говорят о том, к 2022 году мировой рынок иммунохроматографических анализов вырастет до 8,24 миллиардов долларов США (фото любезно предоставлено Alere).

Мировой рынок иммунохроматографических анализов на тест-полосках превысит 8 миллиардов к 2022 году

По прогнозам, мировой рынок иммунохроматографических анализов (ИХА) на тест-полосках вырастет с совокупными темпами годового... Читать дальше
Copyright © 2000-2017 Globetech Media. All rights reserved.