Разделы Партнеры Информация LinkXpress
Вход
Реклама на сайте

Мероприятия

26 Feb 2018 - 01 Mar 2018
05 Mar 2018 - 06 Mar 2018

Тестовые маркеры идентифицируют опухолевую ДНК и определяют местонахождение опухоли

Редакция HospiMedica - Россия
Опубликовано 13 Jul 2017
Print article
Биоинженеры из Калифорнийского университета в Сан-Диего разработали новый анализ крови, который может обнаружить рак и определить, где в организме растет опухоль (фото любезно предоставлено iStock).
Биоинженеры из Калифорнийского университета в Сан-Диего разработали новый анализ крови, который может обнаружить рак и определить, где в организме растет опухоль (фото любезно предоставлено iStock).
Группа молекулярных генетиков разработала диагностический инструмент, который идентифицирует циркулирующую опухолевую ДНК и определяет орган, в котором находится опухоль.

Исследователи из Калифорнийского университета в Сан-Диего (University of California San Diego) основали свой метод на наличии в геноме блоков метилированных гаплотипов. Гаплотип представляет собой набор однонуклеотидных полиморфизмов на одной хромосоме, которые склонны статистически всегда встречаться вместе. Считается, что идентификация этих статистических ассоциаций и нескольких аллелей определенной последовательности гаплотипов может облегчить идентификацию всех других подобных полиморфных сайтов, находящихся поблизости на хромосоме.

Исследователи акцентировали внимание на систематическом поиске и исследовании участков в полном геноме человека, которые показали высококоординированное метилирование. Они определили 147 888 блоков метилированного гаплотипа плотно связанных сайтов CpG. CpG-сайты представляют собой участки ДНК, где за нуклеотидом цитозина следует гуаниновый нуклеотид в линейной последовательности оснований в направлении 5'-3' вдоль. CpG является сокращением для 5'-C-phosphate-G-3', то есть цитозин и гуанин, разделенные только одним фосфатом; фосфат связывает любые два нуклеозида вместе в ДНК. Каждая ткань в организме может быть идентифицирована уникальной сигнатурой метилированных гаплотипов.

Используя данные метилированных гаплотипов, исследователи составили базу данных полных образцов метилирования CpG из 10 различных нормальных тканей (печень, кишечник, толстая кишка, легкие, мозг, почка, поджелудочная железа, селезенка, желудок и кровь). Затем они проанализировали образцы опухоли и крови от больных раком, чтобы собрать базу данных генетических онкомаркеров. Используя эту базу данных, исследователи продемонстрировали количественную оценку опухолевой нагрузки и картирования исходной ткани в циркулирующей бесклеточной ДНК 59 пациентов с раком легкого или колоректальным раком.

"Знание расположения опухоли важно для эффективного раннего выявления, — заявил старший научный сотрудник доктор Кун Чжан (Kun Zhang), профессор биоинженерии в Калифорнийском университете в Сан-Диего. — Это доказательство концепции. Чтобы перенести это исследование на клиническую стадию, нам необходимо сотрудничество с онкологами для дальнейшей оптимизации и усовершенствования этого метода".

"Мы сделали это открытие случайно. Вначале мы применяли традиционный подход и просто искали сигналы раковых клеток и пытались выяснить, откуда они пришли. Однако мы также заметили сигналы от других клеток и поняли, что если мы интегрируем оба набора сигналов вместе, мы могли бы фактически определить наличие или отсутствие опухоли и места, где опухоль растет", — сказал доктор Чжан.

Этот метод был детально описан 6 марта 2017 года в онлайн-версии журнала Nature Genetics.


Print article

Каналы

Химия

посмотреть канал
Система BCS XP – один из наиболее широко используемых, полностью автоматизированных анализаторов гемостаза (фото предоставлено компанией Siemens Healthineers).

Комплексное определение метаболического профиля рассмотрено при хроническом воспалении

Воспаление является ответной реакцией организма на повреждающие воздействия, связанные с активацией различных молекулярных механизмов.... Читать дальше

Гематология

посмотреть канал
Мазок периферической крови, взятой у пациента с эозинофилией, в котором видны пять эозинофилов (фото любезно предоставлено Госпиталем для больных детей в Торонто).

Связанный с уровнем эозинофилов биомаркер способствует выявлению агрессивной формы воспалительного заболевания кишечника

Эозинофилия периферической крови при воспалительном заболевании кишечника связана с неспецифическим язвенным колитом и активным... Читать дальше

Иммунология

посмотреть канал
Диагностика, понимание и лечение болезни Крона будут, по всей видимости, упрощены благодаря исследованию, направленному на разработку лучшего анализа крови для диагностики заболевания (фото любезно предоставлено Университетом штата Аризона).

Иммунопротеомика определяет новые биомаркеры для диагностики болезни Крона

Исследование, базирующееся на новом методе скрининга и направленное на разработку лучшего анализа крови для обнаружения болезни... Читать дальше

Микробиология

посмотреть канал
Анализ Aptima на Mycoplasma genitalium (фото любезно предоставлено Hologic).

Проведена оценка нового анализа Aptima на Mycoplasma genitalium

Возбудитель Mycoplasma genitalium (MG) часто вызывает негонококковый уретрит у мужчин , а также связан с цервицитом, воспалительным... Читать дальше

Патология

посмотреть канал
Сканирующая электронная микрофотография (SEM) клеток рака молочной железы (фото любезно предоставлено SPL).

Анализ крови выявляет резистентность к препаратам, направленным на ген рака молочной железы (BRCA)

Устойчивость к химиотерапии на основе препаратов платины или ингибированию PARP в зародышевой линии носителей мутации BRCA1... Читать дальше

Лаб. технология

посмотреть канал
Система сбора культур крови SteriPath Gen2 (фото любезно предоставлено Magnolia Medical Technologies).

Использование специального устройства привело к снижению уровня контаминации культур крови

Использование механического устройства для извлечения исходных образцов при обучении персонала привело к почти четырехкратному... Читать дальше

Индустрия

посмотреть канал
По прогнозам специалистов, рынок анализов клинической химии будет расти на 3% в течение следующих пяти лет до 19,7 миллиардов долларов США в 2021 году (фото любезно предоставлено Shutterstock).

Рынок клинической химии достигнет 19,7 миллиардов долларов США в 2021 году

Ожидается, что рынок анализов клинической химии будет расти на 3% в течение следующих пяти лет, начиная с 17,8 миллиардов... Читать дальше
Copyright © 2000-2018 Globetech Media. All rights reserved.