Мы используем технологию cookie для понимания того, как вы пользуетесь нашим сайтом. Под этим подразумевается персонализированный контент и реклама. Для того, чтобы узнать больше - нажмите сюда. Пользуясь данным сайтом вы подтверждаете согласие с нашей политикой. Политика cookie.
Разделы Партнеры Информация LinkXpress
Вход
Реклама на сайте
SIGMA ALDRICH CORP.

Тестовые маркеры идентифицируют опухолевую ДНК и определяют местонахождение опухоли

Редакция HospiMedica - Россия
Опубликовано 13 Jul 2017
Print article
Биоинженеры из Калифорнийского университета в Сан-Диего разработали новый анализ крови, который может обнаружить рак и определить, где в организме растет опухоль (фото любезно предоставлено iStock).
Биоинженеры из Калифорнийского университета в Сан-Диего разработали новый анализ крови, который может обнаружить рак и определить, где в организме растет опухоль (фото любезно предоставлено iStock).
Группа молекулярных генетиков разработала диагностический инструмент, который идентифицирует циркулирующую опухолевую ДНК и определяет орган, в котором находится опухоль.

Исследователи из Калифорнийского университета в Сан-Диего (University of California San Diego) основали свой метод на наличии в геноме блоков метилированных гаплотипов. Гаплотип представляет собой набор однонуклеотидных полиморфизмов на одной хромосоме, которые склонны статистически всегда встречаться вместе. Считается, что идентификация этих статистических ассоциаций и нескольких аллелей определенной последовательности гаплотипов может облегчить идентификацию всех других подобных полиморфных сайтов, находящихся поблизости на хромосоме.

Исследователи акцентировали внимание на систематическом поиске и исследовании участков в полном геноме человека, которые показали высококоординированное метилирование. Они определили 147 888 блоков метилированного гаплотипа плотно связанных сайтов CpG. CpG-сайты представляют собой участки ДНК, где за нуклеотидом цитозина следует гуаниновый нуклеотид в линейной последовательности оснований в направлении 5'-3' вдоль. CpG является сокращением для 5'-C-phosphate-G-3', то есть цитозин и гуанин, разделенные только одним фосфатом; фосфат связывает любые два нуклеозида вместе в ДНК. Каждая ткань в организме может быть идентифицирована уникальной сигнатурой метилированных гаплотипов.

Используя данные метилированных гаплотипов, исследователи составили базу данных полных образцов метилирования CpG из 10 различных нормальных тканей (печень, кишечник, толстая кишка, легкие, мозг, почка, поджелудочная железа, селезенка, желудок и кровь). Затем они проанализировали образцы опухоли и крови от больных раком, чтобы собрать базу данных генетических онкомаркеров. Используя эту базу данных, исследователи продемонстрировали количественную оценку опухолевой нагрузки и картирования исходной ткани в циркулирующей бесклеточной ДНК 59 пациентов с раком легкого или колоректальным раком.

"Знание расположения опухоли важно для эффективного раннего выявления, — заявил старший научный сотрудник доктор Кун Чжан (Kun Zhang), профессор биоинженерии в Калифорнийском университете в Сан-Диего. — Это доказательство концепции. Чтобы перенести это исследование на клиническую стадию, нам необходимо сотрудничество с онкологами для дальнейшей оптимизации и усовершенствования этого метода".

"Мы сделали это открытие случайно. Вначале мы применяли традиционный подход и просто искали сигналы раковых клеток и пытались выяснить, откуда они пришли. Однако мы также заметили сигналы от других клеток и поняли, что если мы интегрируем оба набора сигналов вместе, мы могли бы фактически определить наличие или отсутствие опухоли и места, где опухоль растет", — сказал доктор Чжан.

Этот метод был детально описан 6 марта 2017 года в онлайн-версии журнала Nature Genetics.


Print article

Каналы

Химия

посмотреть канал
Новое исследование показывает, что ожирение, которое влияет на печень, может сыграть определенную роль в развитии болезни Альцгеймера и деменции в отдаленном будущем (фото предоставлено Deposit Photos).

На риск развития болезни Альцгеймера влияет состояние печени и диета

Сниженные уровни плазмалогенов имеют связь с повышенным риском болезни Альцгеймера. Плазмалогены вырабатываются в печени... Читать дальше

Гематология

посмотреть канал
Мазок крови показывает гетерогенность размера периферических эритроцитов, известную как анизоцитоз (фото любезно предоставлено доктором медицины Джей Парк (Jay Park)).

Гематологические параметры прогнозируют тяжесть острого панкреатита

Острый панкреатит (ОП) - острое воспаление паренхимы поджелудочной железы, вызванное активированными ферментами поджелудочной... Читать дальше

Иммунология

посмотреть канал
Ревматоидный артрит может вызвать ряд изнуряющих симптомов, включая боль и отек в суставах, усталость и депрессию (фото любезно предоставлено SPL).

Генетические сигнатуры и биомаркеры предсказывают возникновение ревматоидного артрита

Ревматоидный артрит характеризуется воспалением суставов, приводящим к разрушению кости и хряща. Поскольку структурное повреждение... Читать дальше

Микробиология

посмотреть канал
Микрофотография окрашенного по Гимзе тонкого мазка крови, которая показывает наличие многочисленных кольцевых форм трофозоитов Plasmodium falciparum с некоторыми инфицированными эритроцитами, скрывающими различные организмы (фото любезно предоставлено Центром по контролю и профилактике заболеваний / Стивен Гленн (Steven Glenn)).

Проведено сравнение диагностических методов по выявлению малярии

Малярия является тотальной проблемой здравоохранения в тропических развивающихся странах. В настоящее время это наиболее... Читать дальше

Патология

посмотреть канал
Набор для обратной транскрипции Sensiscript, использующий очень небольшое количество РНК, идеально подходит для случаев применения, требующих высокой чувствительности (фото любезно предоставлено Qiagen).

Определен новый белок-мишень для выявления рака толстой кишки

Колоректальный рак (КРР) является третьим наиболее часто диагностируемым онкологическим заболеванием и третьей ведущей причиной... Читать дальше

Лаб. технология

посмотреть канал
Гибридизация нуклеиновой кислоты на электрически реконфигурируемой сети из магнитных наночастиц с золотым покрытием позволяет обнаруживать микроРНК в крови (фото любезно предоставлено Университетом Нового Южного Уэльса).

Инструмент на основе магнитных наночастиц поможет обнаруживать микроРНК

Разработан метод на основе магнитных наночастиц для непосредственного обнаружения микроРНК в необработанных образцах цельной... Читать дальше

Индустрия

посмотреть канал
По прогнозам специалистов, глобальный рынок портативного коагулогического исследования будет расти частично благодаря растущему гериатрическому населению во всем мире (фото любезно предоставлено Shutterstock).

Глобальный рынок коагулогического исследования по месту лечения обусловлен увеличением численности гериатрического населения

По прогнозам специалистов, глобальный рынок портативного тестирования на коагуляцию будет расти с совокупными темпами годового... Читать дальше
Copyright © 2000-2018 Globetech Media. All rights reserved.