Мы используем технологию cookie для понимания того, как вы пользуетесь нашим сайтом. Под этим подразумевается персонализированный контент и реклама. Для того, чтобы узнать больше - нажмите сюда. Пользуясь данным сайтом вы подтверждаете согласие с нашей политикой. Политика cookie.
Разделы Партнеры Информация LinkXpress
Вход
Реклама на сайте
RANDOX LABORATORIES

Тестовые маркеры идентифицируют опухолевую ДНК и определяют местонахождение опухоли

Редакция HospiMedica - Россия
Опубликовано 13 Jul 2017
Print article
Биоинженеры из Калифорнийского университета в Сан-Диего разработали новый анализ крови, который может обнаружить рак и определить, где в организме растет опухоль (фото любезно предоставлено iStock).
Биоинженеры из Калифорнийского университета в Сан-Диего разработали новый анализ крови, который может обнаружить рак и определить, где в организме растет опухоль (фото любезно предоставлено iStock).
Группа молекулярных генетиков разработала диагностический инструмент, который идентифицирует циркулирующую опухолевую ДНК и определяет орган, в котором находится опухоль.

Исследователи из Калифорнийского университета в Сан-Диего (University of California San Diego) основали свой метод на наличии в геноме блоков метилированных гаплотипов. Гаплотип представляет собой набор однонуклеотидных полиморфизмов на одной хромосоме, которые склонны статистически всегда встречаться вместе. Считается, что идентификация этих статистических ассоциаций и нескольких аллелей определенной последовательности гаплотипов может облегчить идентификацию всех других подобных полиморфных сайтов, находящихся поблизости на хромосоме.

Исследователи акцентировали внимание на систематическом поиске и исследовании участков в полном геноме человека, которые показали высококоординированное метилирование. Они определили 147 888 блоков метилированного гаплотипа плотно связанных сайтов CpG. CpG-сайты представляют собой участки ДНК, где за нуклеотидом цитозина следует гуаниновый нуклеотид в линейной последовательности оснований в направлении 5'-3' вдоль. CpG является сокращением для 5'-C-phosphate-G-3', то есть цитозин и гуанин, разделенные только одним фосфатом; фосфат связывает любые два нуклеозида вместе в ДНК. Каждая ткань в организме может быть идентифицирована уникальной сигнатурой метилированных гаплотипов.

Используя данные метилированных гаплотипов, исследователи составили базу данных полных образцов метилирования CpG из 10 различных нормальных тканей (печень, кишечник, толстая кишка, легкие, мозг, почка, поджелудочная железа, селезенка, желудок и кровь). Затем они проанализировали образцы опухоли и крови от больных раком, чтобы собрать базу данных генетических онкомаркеров. Используя эту базу данных, исследователи продемонстрировали количественную оценку опухолевой нагрузки и картирования исходной ткани в циркулирующей бесклеточной ДНК 59 пациентов с раком легкого или колоректальным раком.

"Знание расположения опухоли важно для эффективного раннего выявления, — заявил старший научный сотрудник доктор Кун Чжан (Kun Zhang), профессор биоинженерии в Калифорнийском университете в Сан-Диего. — Это доказательство концепции. Чтобы перенести это исследование на клиническую стадию, нам необходимо сотрудничество с онкологами для дальнейшей оптимизации и усовершенствования этого метода".

"Мы сделали это открытие случайно. Вначале мы применяли традиционный подход и просто искали сигналы раковых клеток и пытались выяснить, откуда они пришли. Однако мы также заметили сигналы от других клеток и поняли, что если мы интегрируем оба набора сигналов вместе, мы могли бы фактически определить наличие или отсутствие опухоли и места, где опухоль растет", — сказал доктор Чжан.

Этот метод был детально описан 6 марта 2017 года в онлайн-версии журнала Nature Genetics.


Print article

Каналы

Химия

посмотреть канал
Simoa 2.0, ультрачувствительная платформа для иммуноанализа, используемая для измерения тау-белка плазмы и сывороточного NfL (фото любезно предоставлено Quanterix).

Определен биомаркер на основе анализа крови для выявления скрытой травмы головного мозга

Высокочувствительный анализ крови поможет определить, когда хоккеистам, пережившим сотрясение мозга, можно безопасно вернуться к игре.... Читать дальше

Гематология

посмотреть канал
HiSeq 4000 Systems использует инновационную технологию структурированных проточных ячеек для обеспечения быстрого и высокопроизводительного секвенирования (фото любезно предоставлено Illumina).

Молекулярные тесты являются эквивалентными анализу костного мозга на множественную миелому

Множественная миелома (ММ) представляет собой гематологическую злокачественную опухоль, характеризующуюся инфильтрацией костного... Читать дальше

Иммунология

посмотреть канал
Времяпролётный масс-спектрометр с матрично-активированной лазерной десорбцией/ионизацией SimulToF (фото любезно предоставлено Virgin Instruments).

Белковая подпись влияет на исход при метастатической меланоме

Клинические результаты метастатической меланомы при применении антител ниволумаба и пембролизумаба, действующих против PD-1... Читать дальше

Микробиология

посмотреть канал
Гистопатология воспалительного инфильтрата глубоких вен со стенкой, диссоциированной отеком, наблюдаемая при поражении кожи у пациента с проказой, страдающего эпизодом узловатой эритемы (фото любезно предоставлено Институтом Освальдо Круса).

У пациентов с проказой обнаружены необычные кровяные сгустки

Проказа представляет собой хроническую инфекцию Mycobacterium leprae и вызывает общеорганизменные симптомы, деформации и инвалидность.... Читать дальше

Патология

посмотреть канал
Гистопатологическая микрофотография биопсии печени со стеатогепатитом, демонстрирующим дегенерацию гепатоцитов с раздуванием – форму апоптоза (фото любезно предоставлено Nephron).

Система анализа изображений оценивает активность НС-заболеваний

Неалкогольный стеатогепатит (НС) представляет собой прогрессирующую форму неалкогольной жировой болезни печени (НЖБП), при... Читать дальше

Лаб. технология

посмотреть канал
На рисунке показано, как упрощение диагностики болезни с использованием нанотехнологий, применяемых на местном уровне, может изменить способ диагностики и лечения кожных заболеваний, таких как аномальные рубцы (фото любезно предоставлено Наньянским технологическим университетом).

Актуальная нанотехнология упрощает диагностику заболеваний кожи

Биопсии тканей необходимы для точного диагноза кожных заболеваний, но их выполнение сопровождается болевыми ощущениями, неудобством... Читать дальше

Индустрия

посмотреть канал
Глобальный рынок портативных устройств мониторинга уровня глюкозы в крови, как ожидается, будет в основном стимулироваться государственными и частными инициативами по сокращению случаев заболевания диабетом (фото любезно предоставлено Roche).

Определены основные факторы, влияющие на глобальный рынок портативных устройств мониторинга уровня глюкозы

Ожидается, что глобальный рынок устройств мониторинга уровня глюкозы в крови будет расти с совокупными темпами годового роста... Читать дальше
Copyright © 2000-2018 Globetech Media. All rights reserved.