Мы используем технологию cookie для понимания того, как вы пользуетесь нашим сайтом. Под этим подразумевается персонализированный контент и реклама. Для того, чтобы узнать больше - нажмите сюда. Пользуясь данным сайтом вы подтверждаете согласие с нашей политикой. Политика cookie.

Please note that the LabMedica website is also available in a complete English version
Разделы Партнеры Информация LinkXpress
Вход
Реклама на сайте
GLOBETECH PUBLISHING LLC

Мобильное Приложение




Метод MALDI-TOF MS идентифицирует оомицет, вызывающий питиоз

Редакция HospiMedica - Россия
Опубликовано 13 Dec 2018
Print article
Масс-спектрометр UltrafleXtreme MALDI-TOF/TOF (фото предоставлено Bruker Daltonics).
Масс-спектрометр UltrafleXtreme MALDI-TOF/TOF (фото предоставлено Bruker Daltonics).
Питиоз является инвазивным, трудно поддающимся лечению и опасным для жизни инфекционным заболеванием, вызываемым Pythium insidiosum, членом уникальной группы грибоподобных микроорганизмов – оомицетов. О случаях заболевания питиозом во всем мире сообщается всё чаще.
В последнее десятилетие времяпролетная масс-спектрометрия с матрично-активированной лазерной десорбцией/ионизацией (MALDI-TOF MS) стала новым мощным диагностическим инструментом, облегчающим клиническую идентификацию многих патогенных микроорганизмов, включая бактерии и грибы.

Ученые из Университета Махидола (Бангкок, Таиланд) выделили в общей сложности 13 штаммов P. Insidiosum от образцов, полученных от 8 человек и 5 животных с питиозом из разных географических мест. Все организмы выдерживали на декстрозном агаре Сабуро при 25 °С. Несколько небольших порций колонии каждого организма были перенесены в 50-миллилитровую колбу, содержащую 10 мл бульона Сабуро с декстрозой, и инкубировались при 37 °С в течение одной недели перед сбором грибкового материала для экстракции белка.

Извлеченный из собранных организмов белок был нанесен на чистую матовую стальную пластину-мишень в 40 копиях (для создания базы данных MS MALDI-TOF для P. insidiosum) или в 5 копиях (для оценки MALDI-TOF MS при идентификации P. insidiosum) и высушен на воздухе при комнатной температуре перед обработкой. После сушки матричного раствора при комнатной температуре образец был немедленно проанализирован с использованием масс-спектрометра Bruker ultrafleXtreme. Матрицы геномной ДНК (gDNA) были извлечены из организмов и подвергнуты мультиплексной полимеразной цепной реакции для определения однонуклеотидного полиморфизма. (PCR).

Команда сообщила, что метод MALDI-TOF MS точно идентифицировал все 13 протестированных штаммов P. insidiosum на уровне видов. Масс-спектры P. insidiosum не соответствовали никаким другим микроорганизмам, включая грибы (т.е. виды Aspergillus, Fusarium и виды грибов класса Zygomycetes), которые имеют сходную микроскопическую морфологию с этим оомицетом. Методы биотипирования на основе MALDI-TOF MS и рДНК последовательно разделили P. insidiosum на три группы: Clade-I (американские штаммы), II (азиатские и австралийские штаммы) и III (в основном тайские штаммы).

Авторы пришли к выводу, что метод MALDI-TOF MS был успешно использован для идентификации и биотипирования P. insidiosum. Полученная база масс-спектральных данных позволит клиническим микробиологическим лабораториям, которые в достаточной мере оборудованы масс-спектрометрами MALDI-TOF, надежно идентифицировать P. Insidiosum без каких-либо специфических для патогена реагентов (антигенов, антител или праймеров). Исследование было опубликовано в декабрьском выпуске International Journal of Infectious Diseases за 2018 год.

Ссылки по теме:
Mahidol University


Print article
Mayo Medical Laboratories

Каналы

Химия

посмотреть канал
Гистопатология неалкогольной жировой болезни печени с паттерном фиброза вокруг гепатоцитов (фото предоставлено университетской больницей Marqués de Valdecilla).

Показатель С-пептида связан с воспалительным прогрессированием НАЖБП

Неалкогольная жировая болезнь печени (НАЖБП) характеризуется аномальным накоплением жира в печени, что обусловлено причинами,... Читать дальше

Молекулярная диагностика

посмотреть канал
Нейроны из ткани мозга крысы окрашены в зеленый цвет антителами к убиквитин-С-концевой гидролазе L1 (UCH-L1), что сильнее подчеркивает клеточное тело и слабее –  процессы клетки. Астроциты окрашены в красный цвет антителом к белку GFAP, обнаруженному в цитоплазматических филаментах. Ядра всех типов клеток окрашены в синий цвет с помощью ДНК-связывающего красителя (фото любезно предоставлено Wikimedia Commons).

Измерение уровня белка в крови поможет диагностировать сотрясение мозга

Простой анализ крови выявляет наличие черепно-мозговой травмы за счет измерения уровней двух белков мозга, которые попадают... Читать дальше

Гематология

посмотреть канал
Жертвы с серьезными травмами, которые получают переливания единиц эритроцитарной массы, хранящихся в течение 22 дней или больше, могут столкнуться с повышенным риском смерти в течение 24 часов (фото любезно предоставлено службой патологии юго-западного Лондона /South West London Pathology/).

Переливание крови, бывшей длительное время на хранении, связано с неблагоприятными явлениями

Ведущей причиной смерти после тяжелой травмы является потеря крови. Жертвы с серьезными травмами, которые получают переливания... Читать дальше

Иммунология

посмотреть канал
Химический анализатор RX Daytona – компактный, полностью автоматизированный настольный клинический химический анализатор, идеально подходящий для лабораторий с малой и средней пропускной способностью (фото любезно предоставлено Randox Laboratories).

Мочевые биомаркеры позволяют диагностировать серьезные аллергические реакции почек

Острый интерстициальный нефрит (ОИН) представляет собой состояние, характеризующееся воспалением и отеком почечных канальцев... Читать дальше

Лаб. технология

посмотреть канал
(A) и (B) – микрофотографии слоев устройства; (C) – пресс-форма, готовая к разливке, и (D) – чип, установленный на предметном стекле. Фото любезно предоставлено Государственным университетом Сан-Диего.

Микрофлюидное устройство изолирует кластеры циркулирующих опухолевых клеток

Тремя основными проблемами при лечении рака являются метастазы, рецидивы и приобретенная резистентность к терапии.... Читать дальше

Патология

посмотреть канал
Набор для исследования с использованием микропанели The Quick-Ray Manual Tissue Microarrayer Set (фото любезно предоставлено компанией Unitma).

Проведён сравнительный анализ диагностических панелей по выявлению рака легких

Рак легких является ведущей причиной смерти от онкологических заболеваний. Немелкоклеточный рак легкого - наиболее распространенный... Читать дальше

Индустрия

посмотреть канал
По прогнозам специалистов, мировой рынок диагностики in vitro будет расти в период между 2017 и 2025 годами и к концу 2025 года достигнет почти 90 миллиардов долларов США (фото любезно предоставлено iStock).

К 2025 году мировой рынок диагностики in vitro достигнет 89 миллиардов долларов США

Мировой рынок диагностики in vitro был оценен в 55,00 миллиардов долларов США в 2016 году и, согласно прогнозам, будет расти... Читать дальше
Copyright © 2000-2019 Globetech Media. All rights reserved.