Мы используем технологию cookie для понимания того, как вы пользуетесь нашим сайтом. Под этим подразумевается персонализированный контент и реклама. Для того, чтобы узнать больше - нажмите сюда. Пользуясь данным сайтом вы подтверждаете согласие с нашей политикой. Политика cookie.
Please note that the LabMedica website is also available in a complete English version
Разделы Партнеры Информация LinkXpress
Вход
Реклама на сайте
GLOBETECH PUBLISHING LLC

Мобильное Приложение




Метод MALDI-TOF MS идентифицирует оомицет, вызывающий питиоз

Редакция HospiMedica - Россия
Опубликовано 13 Dec 2018
Print article
Масс-спектрометр UltrafleXtreme MALDI-TOF/TOF (фото предоставлено Bruker Daltonics).
Масс-спектрометр UltrafleXtreme MALDI-TOF/TOF (фото предоставлено Bruker Daltonics).
Питиоз является инвазивным, трудно поддающимся лечению и опасным для жизни инфекционным заболеванием, вызываемым Pythium insidiosum, членом уникальной группы грибоподобных микроорганизмов – оомицетов. О случаях заболевания питиозом во всем мире сообщается всё чаще.
В последнее десятилетие времяпролетная масс-спектрометрия с матрично-активированной лазерной десорбцией/ионизацией (MALDI-TOF MS) стала новым мощным диагностическим инструментом, облегчающим клиническую идентификацию многих патогенных микроорганизмов, включая бактерии и грибы.

Ученые из Университета Махидола (Бангкок, Таиланд) выделили в общей сложности 13 штаммов P. Insidiosum от образцов, полученных от 8 человек и 5 животных с питиозом из разных географических мест. Все организмы выдерживали на декстрозном агаре Сабуро при 25 °С. Несколько небольших порций колонии каждого организма были перенесены в 50-миллилитровую колбу, содержащую 10 мл бульона Сабуро с декстрозой, и инкубировались при 37 °С в течение одной недели перед сбором грибкового материала для экстракции белка.

Извлеченный из собранных организмов белок был нанесен на чистую матовую стальную пластину-мишень в 40 копиях (для создания базы данных MS MALDI-TOF для P. insidiosum) или в 5 копиях (для оценки MALDI-TOF MS при идентификации P. insidiosum) и высушен на воздухе при комнатной температуре перед обработкой. После сушки матричного раствора при комнатной температуре образец был немедленно проанализирован с использованием масс-спектрометра Bruker ultrafleXtreme. Матрицы геномной ДНК (gDNA) были извлечены из организмов и подвергнуты мультиплексной полимеразной цепной реакции для определения однонуклеотидного полиморфизма. (PCR).

Команда сообщила, что метод MALDI-TOF MS точно идентифицировал все 13 протестированных штаммов P. insidiosum на уровне видов. Масс-спектры P. insidiosum не соответствовали никаким другим микроорганизмам, включая грибы (т.е. виды Aspergillus, Fusarium и виды грибов класса Zygomycetes), которые имеют сходную микроскопическую морфологию с этим оомицетом. Методы биотипирования на основе MALDI-TOF MS и рДНК последовательно разделили P. insidiosum на три группы: Clade-I (американские штаммы), II (азиатские и австралийские штаммы) и III (в основном тайские штаммы).

Авторы пришли к выводу, что метод MALDI-TOF MS был успешно использован для идентификации и биотипирования P. insidiosum. Полученная база масс-спектральных данных позволит клиническим микробиологическим лабораториям, которые в достаточной мере оборудованы масс-спектрометрами MALDI-TOF, надежно идентифицировать P. Insidiosum без каких-либо специфических для патогена реагентов (антигенов, антител или праймеров). Исследование было опубликовано в декабрьском выпуске International Journal of Infectious Diseases за 2018 год.

Ссылки по теме:
Mahidol University


Print article
BIOHIT  Healthcare OY

Каналы

Химия

посмотреть канал
Новый анализ крови гарантирует практически мгновенную постановку диагноза сердечного приступа с использованием недавно открытого биомаркера белка (фото любезно предоставлено iStock).

Разработан новый анализ крови на инфаркт миокарда

Уровень сердечного миозин-связывающего белка C (cMyC) в крови после инфаркта миокарда повышается быстрее и в большей степени,... Читать дальше

Молекулярная диагностика

посмотреть канал
Цветная электронная микрофотография, показывающая малярийного паразита (справа, синего цвета), сцепленного с эритроцитом человека. На вставке показан фрагмент точки контакта при большем увеличении (фото любезно предоставлено [США] NIAID через Wikimedia Commons).

Анализ капли крови позволит осуществлять мониторинг устойчивости к противомалярийным препаратам

Разработан новый метод анализа ДНК непосредственно по капле крови, который поможет осуществлять мониторинг развития устойчивости... Читать дальше

Гематология

посмотреть канал
Жертвы с серьезными травмами, которые получают переливания единиц эритроцитарной массы, хранящихся в течение 22 дней или больше, могут столкнуться с повышенным риском смерти в течение 24 часов (фото любезно предоставлено службой патологии юго-западного Лондона /South West London Pathology/).

Переливание крови, бывшей длительное время на хранении, связано с неблагоприятными явлениями

Ведущей причиной смерти после тяжелой травмы является потеря крови. Жертвы с серьезными травмами, которые получают переливания... Читать дальше

Иммунология

посмотреть канал
Уникальный наконечник для пипетки, созданный на 3D-принтере, для проведения иммуноферментных анализов (фото любезно предоставлено Университетом Коннектикута).

Новая технология 3D-печати снижает стоимость иммуноферментного анализа

Традиционный иммуноферментный анализ (ИФА) проводят на планшетах с 96 микролунками; каждая лунка работает как отдельная испытательная... Читать дальше

Патология

посмотреть канал
Портативное устройство MasSpec Pen, которое можно подключить к масс-спектрометру для диагностики рака яичников и других видов рака (фото любезно предоставлено Техасским университетом в Остине).

Устройство Masspec Pen одобрено для быстрой диагностики рака

Рак яичников является заболеванием c чрезвычайно высокой смертностью и пятой по значимости причиной всех связанных с раком... Читать дальше

Лаб. технология

посмотреть канал
Наноэлектронный анализ: клетки крови в напряженном состоянии могут выступать в качестве биомаркера хронической усталости (фото любезно предоставлено The Scientist).

Разработан биомаркерный тест, который поможет выявлять синдром хронической усталости

Миалгический энцефаломиелит, или синдром хронической усталости (МЭ/СХУ), является серьезным заболеванием, которое может затронуть... Читать дальше

Индустрия

посмотреть канал
По прогнозам специалистов, мировой рынок диагностики in vitro будет расти в период между 2017 и 2025 годами и к концу 2025 года достигнет почти 90 миллиардов долларов США (фото любезно предоставлено iStock).

К 2025 году мировой рынок диагностики in vitro достигнет 89 миллиардов долларов США

Мировой рынок диагностики in vitro был оценен в 55,00 миллиардов долларов США в 2016 году и, согласно прогнозам, будет расти... Читать дальше
Copyright © 2000-2019 Globetech Media. All rights reserved.