Мы используем технологию cookie для понимания того, как вы пользуетесь нашим сайтом. Под этим подразумевается персонализированный контент и реклама. Для того, чтобы узнать больше - нажмите сюда. Пользуясь данным сайтом вы подтверждаете согласие с нашей политикой. Политика cookie.
Please note that the LabMedica website is also available in a complete English version
Разделы Партнеры Информация LinkXpress
Вход
Реклама на сайте
RANDOX LABORATORIES

Метод MALDI-TOF MS идентифицирует оомицет, вызывающий питиоз

Редакция HospiMedica - Россия
Опубликовано 13 Dec 2018
Print article
Масс-спектрометр UltrafleXtreme MALDI-TOF/TOF (фото предоставлено Bruker Daltonics).
Масс-спектрометр UltrafleXtreme MALDI-TOF/TOF (фото предоставлено Bruker Daltonics).
Питиоз является инвазивным, трудно поддающимся лечению и опасным для жизни инфекционным заболеванием, вызываемым Pythium insidiosum, членом уникальной группы грибоподобных микроорганизмов – оомицетов. О случаях заболевания питиозом во всем мире сообщается всё чаще.
В последнее десятилетие времяпролетная масс-спектрометрия с матрично-активированной лазерной десорбцией/ионизацией (MALDI-TOF MS) стала новым мощным диагностическим инструментом, облегчающим клиническую идентификацию многих патогенных микроорганизмов, включая бактерии и грибы.

Ученые из Университета Махидола (Бангкок, Таиланд) выделили в общей сложности 13 штаммов P. Insidiosum от образцов, полученных от 8 человек и 5 животных с питиозом из разных географических мест. Все организмы выдерживали на декстрозном агаре Сабуро при 25 °С. Несколько небольших порций колонии каждого организма были перенесены в 50-миллилитровую колбу, содержащую 10 мл бульона Сабуро с декстрозой, и инкубировались при 37 °С в течение одной недели перед сбором грибкового материала для экстракции белка.

Извлеченный из собранных организмов белок был нанесен на чистую матовую стальную пластину-мишень в 40 копиях (для создания базы данных MS MALDI-TOF для P. insidiosum) или в 5 копиях (для оценки MALDI-TOF MS при идентификации P. insidiosum) и высушен на воздухе при комнатной температуре перед обработкой. После сушки матричного раствора при комнатной температуре образец был немедленно проанализирован с использованием масс-спектрометра Bruker ultrafleXtreme. Матрицы геномной ДНК (gDNA) были извлечены из организмов и подвергнуты мультиплексной полимеразной цепной реакции для определения однонуклеотидного полиморфизма. (PCR).

Команда сообщила, что метод MALDI-TOF MS точно идентифицировал все 13 протестированных штаммов P. insidiosum на уровне видов. Масс-спектры P. insidiosum не соответствовали никаким другим микроорганизмам, включая грибы (т.е. виды Aspergillus, Fusarium и виды грибов класса Zygomycetes), которые имеют сходную микроскопическую морфологию с этим оомицетом. Методы биотипирования на основе MALDI-TOF MS и рДНК последовательно разделили P. insidiosum на три группы: Clade-I (американские штаммы), II (азиатские и австралийские штаммы) и III (в основном тайские штаммы).

Авторы пришли к выводу, что метод MALDI-TOF MS был успешно использован для идентификации и биотипирования P. insidiosum. Полученная база масс-спектральных данных позволит клиническим микробиологическим лабораториям, которые в достаточной мере оборудованы масс-спектрометрами MALDI-TOF, надежно идентифицировать P. Insidiosum без каких-либо специфических для патогена реагентов (антигенов, антител или праймеров). Исследование было опубликовано в декабрьском выпуске International Journal of Infectious Diseases за 2018 год.

Ссылки по теме:
Mahidol University


Print article

Каналы

Химия

посмотреть канал
Ученые исследовали, может ли время реакции С-пептида в процессе прохождения перорального теста на толерантность к глюкозе объяснить колебание уровней HbA1c при диагностике диабета 1 типа (фото любезно предоставлено доктором медицины Амитом Акировым).

Время ответной реакции С-пептида может объяснить колебание уровней HbA1c

Учёт времени ответной реакции С-пептида может частично объяснить изменение уровня гликированного гемоглобина (HbA1c) при... Читать дальше

Молекулярная диагностика

посмотреть канал
Мутационная нагрузка опухоли, определенная целенаправленным секвенированием нового поколения, предсказывает эффективность ингибиторов контрольных точек иммунного ответа для лечения рака (фото любезно предоставлено Онкологическим институтом Рутгерса).

Мутационная нагрузка опухоли прогнозирует выживание после иммунотерапии

Изучение тысяч случаев прогрессирующего рака позволяет предположить способ определения тех опухолей, которые будут с наибольшей... Читать дальше

Гематология

посмотреть канал
Жертвы с серьезными травмами, которые получают переливания единиц эритроцитарной массы, хранящихся в течение 22 дней или больше, могут столкнуться с повышенным риском смерти в течение 24 часов (фото любезно предоставлено службой патологии юго-западного Лондона /South West London Pathology/).

Переливание крови, бывшей длительное время на хранении, связано с неблагоприятными явлениями

Ведущей причиной смерти после тяжелой травмы является потеря крови. Жертвы с серьезными травмами, которые получают переливания... Читать дальше

Иммунология

посмотреть канал
ИФА-тест PicoAMH измеряет количество антимюллерового гормона (AMH) в крови (фото любезно предоставлено Ansh Labs).

Диагностический тест помогает определить менопаузальный статус

Менопауза - это период в жизни женщины, когда у нее прекращается менструальный цикл и она перестает быть фертильной.... Читать дальше

Патология

посмотреть канал
Диаграмма эволюционных траекторий глиобластом IDH-WT, демонстрирующая типичный путь раннего онкогенеза, инициированного за несколько лет до первоначальной диагностики (фото любезно предоставлено Немецким онкологическим исследовательским центром German Cancer Research Center).

Мутации драйвера развития глиобластомы появляются задолго до постановки диагноза

Глиобластомы являются наиболее распространенной (раковой) первичной опухолью головного мозга у взрослых. В редких случаях... Читать дальше

Лаб. технология

посмотреть канал
Схематическое изображение чипа µLAS с двумя независимыми каналами, приводимыми в действие одинаковым давлением и напряжением. Каждый канал содержит область воронки, которая функционирует для разделения и концентрации ДНК (фото любезно предоставлено Университетом Лозанны).

Генетические методы позволяют быстро диагностировать болезнь Хантингтона

Люди с болезнью Хантингтона страдают от резких движений тела и снижения умственных способностей. Состояние обычно приводит... Читать дальше

Индустрия

посмотреть канал
По прогнозам специалистов, мировой рынок диагностики in vitro будет расти в период между 2017 и 2025 годами и к концу 2025 года достигнет почти 90 миллиардов долларов США (фото любезно предоставлено iStock).

К 2025 году мировой рынок диагностики in vitro достигнет 89 миллиардов долларов США

Мировой рынок диагностики in vitro был оценен в 55,00 миллиардов долларов США в 2016 году и, согласно прогнозам, будет расти... Читать дальше
Copyright © 2000-2019 Globetech Media. All rights reserved.