Мы используем технологию cookie для понимания того, как вы пользуетесь нашим сайтом. Под этим подразумевается персонализированный контент и реклама. Для того, чтобы узнать больше - нажмите сюда. Пользуясь данным сайтом вы подтверждаете согласие с нашей политикой. Политика cookie.
Please note that the LabMedica website is also available in a complete English version
Разделы Партнеры Информация LinkXpress
Вход
Реклама на сайте
BECKMAN COULTER, INC.

Мобильное Приложение




Времяпролётная масс-спектрометрия с лазерной ионизацией и десорбцией из жидкой матрицы поможет идентифицировать питиоз

Редакция HospiMedica - Россия
Опубликовано 17 Oct 2018
Print article
Времяпролётный масс-спектрометр с лазерной ионизацией и десорбцией из жидкой матрицы (фото любезно предоставлено Bruker Daltonics).
Времяпролётный масс-спектрометр с лазерной ионизацией и десорбцией из жидкой матрицы (фото любезно предоставлено Bruker Daltonics).
Питиоз - опасное для жизни инфекционное заболевание, вызываемое оомицетом Pythium insidiosum. Болезнь все чаще регистрируется во всем мире, и большинство пациентов с питиозом подвергаются хирургическому удалению инфицированного органа.

В последнее десятилетие появился новый мощный диагностический инструмент для упрощения клинической идентификации многих патогенных микроорганизмов, включая бактерии и грибы, – времяпролётная масс-спектрометрия с лазерной ионизацией и десорбцией из жидкой матрицы (matrix-assisted laser desorption ionization–time of flight mass spectrometry - MALDI-TOF MS).

Ученые из Университета Махидола (Mahidol University; Бангкок, Таиланд) выделили в общей сложности 13 штаммов P. insidiosum от восьми человек и пяти животных с питиозом из разных географических местоположений; полученные штаммы были разделены на две группы. Все организмы поддерживались на сабуро-декстрозном агаре при 25 °С. Несколько небольших частей колонии каждого организма были перенесены в 50-миллилитровую колбу, содержащую 10 мл сабуро-декстрозного бульона, и инкубированы при 37 °С в течение одной недели, прежде чем грибковый материал для экстракции белка был собран.

Белок извлекался из организмов и экстрагированный белоксодержащий супернатант наносился на чистую пластину из шлифованной стали в 40 копиях (для получения базы данных MALDI-TOF MS P. insidiosum) или 5 копиях (для оценки MALDI-TOF MS на идентификацию P. insidiosum), после он был просушен на воздухе при комнатной температуре и покрыт 0,5 мкл матричного раствора. Шаблоны геномной ДНК (gDNA) экстрагировались из организмов и подвергались мультиплексной полимеразной цепной реакции (ПЦР) на основе точечного нуклеотидного полиморфизма.

Ученые сообщили, что MALDI-TOF MS точно идентифицировала все 13 штаммов P. insidiosum, проверенные на уровне видов. Масс-спектры P. insidiosum не соответствовали каким-либо другим микроорганизмам, включая грибы (то есть виды Aspergillus, виды Fusarium и грибковые виды класса Zygomycetes), которые имеют сходные микроскопические морфологии с этим оомицетом. Методы биотипирования на основе секвенирования MALDI-TOF MS и rDNA согласованно классифицировали P. insidiosum на три группы: Clade-I (американские штаммы), II (азиатские и австралийские штаммы) и III (в основном тайские штаммы).

Авторы пришли к выводу, что MALDI-TOF MS была успешно использована для идентификации и биотипирования P. insidiosum. Полученная база масс-спектров позволяет клиническим микробиологическим лабораториям, хорошо оснащенным масс-спектрометром MALDI-TOF, удобно идентифицировать P. insidiosum, не требуя каких-либо патоген-специфических реагентов (т.е. антигены, антитела или праймеры). Исследование было опубликовано 6 сентября 2018 года в Международном журнале инфекционных заболеваний (International Journal of Infectious Diseases).

Ссылки по теме:
Университет Махидола


Print article
BIOHIT  Healthcare OY

Каналы

Химия

посмотреть канал
Анализатор газов крови ABL800 FLEX (фото предоставлено Radiometer Medical).

Соотношение лимфоциты/нейтрофилы и уровни лактата прогнозируют летальность у пациентов с сепсисом

Сепсис является основной причиной наступления смерти от инфекции, а также одной из ведущих причин летальности в отделении... Читать дальше

Молекулярная диагностика

посмотреть канал
Epi ProColon является скрининг-тестом на колоректальный рак на основе крови - анализ полимеразной цепной реакции in vitro для качественного определения метилирования гена Septin9 в ДНК, выделенной из плазмы пациента (фото любезно предоставлено Epigenomics).

Анализ крови дополняет колоноскопию для пациентов с синдромом Линча

Люди с синдромом Линча (СЛ) генетически предрасположены к высокому риску колоректального рака (КРР), и регулярная колоноскопия... Читать дальше

Гематология

посмотреть канал
Жертвы с серьезными травмами, которые получают переливания единиц эритроцитарной массы, хранящихся в течение 22 дней или больше, могут столкнуться с повышенным риском смерти в течение 24 часов (фото любезно предоставлено службой патологии юго-западного Лондона /South West London Pathology/).

Переливание крови, бывшей длительное время на хранении, связано с неблагоприятными явлениями

Ведущей причиной смерти после тяжелой травмы является потеря крови. Жертвы с серьезными травмами, которые получают переливания... Читать дальше

Иммунология

посмотреть канал
Химический анализатор RX Daytona – компактный, полностью автоматизированный настольный клинический химический анализатор, идеально подходящий для лабораторий с малой и средней пропускной способностью (фото любезно предоставлено Randox Laboratories).

Мочевые биомаркеры позволяют диагностировать серьезные аллергические реакции почек

Острый интерстициальный нефрит (ОИН) представляет собой состояние, характеризующееся воспалением и отеком почечных канальцев... Читать дальше

Патология

посмотреть канал
Портативное устройство MasSpec Pen, которое можно подключить к масс-спектрометру для диагностики рака яичников и других видов рака (фото любезно предоставлено Техасским университетом в Остине).

Устройство Masspec Pen одобрено для быстрой диагностики рака

Рак яичников является заболеванием c чрезвычайно высокой смертностью и пятой по значимости причиной всех связанных с раком... Читать дальше

Лаб. технология

посмотреть канал
(A) и (B) – микрофотографии слоев устройства; (C) – пресс-форма, готовая к разливке, и (D) – чип, установленный на предметном стекле. Фото любезно предоставлено Государственным университетом Сан-Диего.

Микрофлюидное устройство изолирует кластеры циркулирующих опухолевых клеток

Тремя основными проблемами при лечении рака являются метастазы, рецидивы и приобретенная резистентность к терапии.... Читать дальше

Индустрия

посмотреть канал
По прогнозам специалистов, мировой рынок диагностики in vitro будет расти в период между 2017 и 2025 годами и к концу 2025 года достигнет почти 90 миллиардов долларов США (фото любезно предоставлено iStock).

К 2025 году мировой рынок диагностики in vitro достигнет 89 миллиардов долларов США

Мировой рынок диагностики in vitro был оценен в 55,00 миллиардов долларов США в 2016 году и, согласно прогнозам, будет расти... Читать дальше
Copyright © 2000-2019 Globetech Media. All rights reserved.