Мы используем технологию cookie для понимания того, как вы пользуетесь нашим сайтом. Под этим подразумевается персонализированный контент и реклама. Для того, чтобы узнать больше - нажмите сюда. Пользуясь данным сайтом вы подтверждаете согласие с нашей политикой. Политика cookie.
Разделы Партнеры Информация LinkXpress
Вход
Реклама на сайте
SIGMA ALDRICH CORP.

American Gut Project сообщает о результатах работы по исследованию микробиома

Редакция HospiMedica - Россия
Опубликовано 11 Sep 2018
Print article
HiSeq 2500 - мощная система с высокой пропускной способностью (фото любезно предоставлено Illumina).
HiSeq 2500 - мощная система с высокой пропускной способностью (фото любезно предоставлено Illumina).
Проведена большая работа, связанная с исследованием человеческого микробиома с конкретными фенотипами и переменными образа жизни, однако данные из разных проектов оказались сложными для интеграции, а степень микробного и молекулярного разнообразия в стуле человека остается неизвестной.

В ноябре 2012 года было запущено два проекта, American Gut Project (AGP) действовал в рамках сотрудничества между Earth Microbiome Project (EMP) и Human Food Project (HFP) для выявления видов микробиологического разнообразия и микробиомов в естественных условиях посредством самозаявленной группы исследователей-любителей.

Многочисленная команда международных ученых, сотрудничающих с Калифорнийским университетом в Сан-Диего (University of California, San Diego; Ла-Хойя, штат Калифорния, США), исследовала образцы стула у людей в США, Великобритании и десятках других стран. Участники прошли добровольные опросы, связанные с их рационом, образом жизни, состоянием здоровья и историей болезни, в том числе около 1800 человек приняли участие в опросе частоты потребления различных пищевых продуктов на основе картинок.

Команда использовала инструменты MiSeq или HiSeq для секвенирования областей 16S рРНК V4 в образцах, чтобы охарактеризовать их микробный состав. Они также культивировали подмножество образцов, которые были подвергнуты метагеномному шотган-секвенированию с помощью Illumina HiSeq 2500 и профилированию метаболитов с помощью высокоэффективной жидкостной хроматографии и масс-спектрометрии (ВЭЖХ-МС).

В дополнение к выраженному общему микробному разнообразию команда отметила, что различия, обнаруженные между отдельно взятым микробиомом кишечника и соседним, иногда совпадают с различиями, описанными в разных средах для EMP. Команда также смогла профилировать микробный состав кишечника у лиц с психическими расстройствами (депрессия, шизофрения, биполярное расстройство или посттравматическое стрессовое расстройство) или без, выявив микробиомы кишечника, которые сгруппированы отдельно от 125 человек, не страдающих этими заболеваниями.

Когда дело дошло до изучения диеты, ученые обнаружили связи между количеством потребляемых человеком видов растений и их микробным разнообразием кишечника, независимо от того, была ли их общая диета веганской или вегетарианской. Аналогичным образом те, кто сообщал о потреблении разнообразной растительной пищи (30 видов пищи растительного происхождения в неделю или более), были менее склонны переносить микроорганизмы с генами устойчивости к антибиотикам по сравнению с теми, кто потреблял в неделю 10 видов растений или меньше. Возможно, более неожиданным было сравнение 139 лиц, недавно принимавших антибиотики, и 117 лиц, которые не получали антибиотики в течение года или более, что выявило рост метаболомического разнообразия после использования антибиотиков, несмотря на снижение микробного разнообразия.

Доктор философии Дэниел Макдональд (Daniel McDonald), научный директор проекта American Gut Project и ведущий автор исследования, сказал: "Мы наблюдали гораздо большее микробное разнообразие, чем в предыдущих более мелких исследованиях, и это говорит о том, что если мы посмотрим на большее количество населения, то увидим больше разнообразия, что важно для определения границ человеческого микробиома". Исследование было опубликовано 15 мая 2018 года в журнале mSystems.

Ссылки по теме:
Калифорнийский университет в Сан-Диего


Print article

Каналы

Химия

посмотреть канал
Новое исследование показывает, что ожирение, которое влияет на печень, может сыграть определенную роль в развитии болезни Альцгеймера и деменции в отдаленном будущем (фото предоставлено Deposit Photos).

На риск развития болезни Альцгеймера влияет состояние печени и диета

Сниженные уровни плазмалогенов имеют связь с повышенным риском болезни Альцгеймера. Плазмалогены вырабатываются в печени... Читать дальше

Молекулярная диагностика

посмотреть канал
Тромбоз глубоких вен (фото предоставлено Wikimedia Commons).

Предложен быстрый метод диагностирования тромбоза глубоких вен

Простой анализ крови был предложен в качестве альтернативы довольно дорогостоящей и интенсивной ультразвуковой процедуре... Читать дальше

Гематология

посмотреть канал
Мазок крови показывает гетерогенность размера периферических эритроцитов, известную как анизоцитоз (фото любезно предоставлено доктором медицины Джей Парк (Jay Park)).

Гематологические параметры прогнозируют тяжесть острого панкреатита

Острый панкреатит (ОП) - острое воспаление паренхимы поджелудочной железы, вызванное активированными ферментами поджелудочной... Читать дальше

Иммунология

посмотреть канал
Ревматоидный артрит может вызвать ряд изнуряющих симптомов, включая боль и отек в суставах, усталость и депрессию (фото любезно предоставлено SPL).

Генетические сигнатуры и биомаркеры предсказывают возникновение ревматоидного артрита

Ревматоидный артрит характеризуется воспалением суставов, приводящим к разрушению кости и хряща. Поскольку структурное повреждение... Читать дальше

Патология

посмотреть канал
Набор для обратной транскрипции Sensiscript, использующий очень небольшое количество РНК, идеально подходит для случаев применения, требующих высокой чувствительности (фото любезно предоставлено Qiagen).

Определен новый белок-мишень для выявления рака толстой кишки

Колоректальный рак (КРР) является третьим наиболее часто диагностируемым онкологическим заболеванием и третьей ведущей причиной... Читать дальше

Лаб. технология

посмотреть канал
Гибридизация нуклеиновой кислоты на электрически реконфигурируемой сети из магнитных наночастиц с золотым покрытием позволяет обнаруживать микроРНК в крови (фото любезно предоставлено Университетом Нового Южного Уэльса).

Инструмент на основе магнитных наночастиц поможет обнаруживать микроРНК

Разработан метод на основе магнитных наночастиц для непосредственного обнаружения микроРНК в необработанных образцах цельной... Читать дальше

Индустрия

посмотреть канал
По прогнозам специалистов, глобальный рынок портативного коагулогического исследования будет расти частично благодаря растущему гериатрическому населению во всем мире (фото любезно предоставлено Shutterstock).

Глобальный рынок коагулогического исследования по месту лечения обусловлен увеличением численности гериатрического населения

По прогнозам специалистов, глобальный рынок портативного тестирования на коагуляцию будет расти с совокупными темпами годового... Читать дальше
Copyright © 2000-2018 Globetech Media. All rights reserved.