Мы используем технологию cookie для понимания того, как вы пользуетесь нашим сайтом. Под этим подразумевается персонализированный контент и реклама. Для того, чтобы узнать больше - нажмите сюда. Пользуясь данным сайтом вы подтверждаете согласие с нашей политикой. Политика cookie.
Please note that the LabMedica website is also available in a complete English version
Разделы Партнеры Информация LinkXpress
Вход
Реклама на сайте
GLOBETECH PUBLISHING LLC

American Gut Project сообщает о результатах работы по исследованию микробиома

Редакция HospiMedica - Россия
Опубликовано 11 Sep 2018
Print article
HiSeq 2500 - мощная система с высокой пропускной способностью (фото любезно предоставлено Illumina).
HiSeq 2500 - мощная система с высокой пропускной способностью (фото любезно предоставлено Illumina).
Проведена большая работа, связанная с исследованием человеческого микробиома с конкретными фенотипами и переменными образа жизни, однако данные из разных проектов оказались сложными для интеграции, а степень микробного и молекулярного разнообразия в стуле человека остается неизвестной.

В ноябре 2012 года было запущено два проекта, American Gut Project (AGP) действовал в рамках сотрудничества между Earth Microbiome Project (EMP) и Human Food Project (HFP) для выявления видов микробиологического разнообразия и микробиомов в естественных условиях посредством самозаявленной группы исследователей-любителей.

Многочисленная команда международных ученых, сотрудничающих с Калифорнийским университетом в Сан-Диего (University of California, San Diego; Ла-Хойя, штат Калифорния, США), исследовала образцы стула у людей в США, Великобритании и десятках других стран. Участники прошли добровольные опросы, связанные с их рационом, образом жизни, состоянием здоровья и историей болезни, в том числе около 1800 человек приняли участие в опросе частоты потребления различных пищевых продуктов на основе картинок.

Команда использовала инструменты MiSeq или HiSeq для секвенирования областей 16S рРНК V4 в образцах, чтобы охарактеризовать их микробный состав. Они также культивировали подмножество образцов, которые были подвергнуты метагеномному шотган-секвенированию с помощью Illumina HiSeq 2500 и профилированию метаболитов с помощью высокоэффективной жидкостной хроматографии и масс-спектрометрии (ВЭЖХ-МС).

В дополнение к выраженному общему микробному разнообразию команда отметила, что различия, обнаруженные между отдельно взятым микробиомом кишечника и соседним, иногда совпадают с различиями, описанными в разных средах для EMP. Команда также смогла профилировать микробный состав кишечника у лиц с психическими расстройствами (депрессия, шизофрения, биполярное расстройство или посттравматическое стрессовое расстройство) или без, выявив микробиомы кишечника, которые сгруппированы отдельно от 125 человек, не страдающих этими заболеваниями.

Когда дело дошло до изучения диеты, ученые обнаружили связи между количеством потребляемых человеком видов растений и их микробным разнообразием кишечника, независимо от того, была ли их общая диета веганской или вегетарианской. Аналогичным образом те, кто сообщал о потреблении разнообразной растительной пищи (30 видов пищи растительного происхождения в неделю или более), были менее склонны переносить микроорганизмы с генами устойчивости к антибиотикам по сравнению с теми, кто потреблял в неделю 10 видов растений или меньше. Возможно, более неожиданным было сравнение 139 лиц, недавно принимавших антибиотики, и 117 лиц, которые не получали антибиотики в течение года или более, что выявило рост метаболомического разнообразия после использования антибиотиков, несмотря на снижение микробного разнообразия.

Доктор философии Дэниел Макдональд (Daniel McDonald), научный директор проекта American Gut Project и ведущий автор исследования, сказал: "Мы наблюдали гораздо большее микробное разнообразие, чем в предыдущих более мелких исследованиях, и это говорит о том, что если мы посмотрим на большее количество населения, то увидим больше разнообразия, что важно для определения границ человеческого микробиома". Исследование было опубликовано 15 мая 2018 года в журнале mSystems.

Ссылки по теме:
Калифорнийский университет в Сан-Диего


Print article

Каналы

Химия

посмотреть канал
Ученые исследовали, может ли время реакции С-пептида в процессе прохождения перорального теста на толерантность к глюкозе объяснить колебание уровней HbA1c при диагностике диабета 1 типа (фото любезно предоставлено доктором медицины Амитом Акировым).

Время ответной реакции С-пептида может объяснить колебание уровней HbA1c

Учёт времени ответной реакции С-пептида может частично объяснить изменение уровня гликированного гемоглобина (HbA1c) при... Читать дальше

Молекулярная диагностика

посмотреть канал
Мутационная нагрузка опухоли, определенная целенаправленным секвенированием нового поколения, предсказывает эффективность ингибиторов контрольных точек иммунного ответа для лечения рака (фото любезно предоставлено Онкологическим институтом Рутгерса).

Мутационная нагрузка опухоли прогнозирует выживание после иммунотерапии

Изучение тысяч случаев прогрессирующего рака позволяет предположить способ определения тех опухолей, которые будут с наибольшей... Читать дальше

Гематология

посмотреть канал
Жертвы с серьезными травмами, которые получают переливания единиц эритроцитарной массы, хранящихся в течение 22 дней или больше, могут столкнуться с повышенным риском смерти в течение 24 часов (фото любезно предоставлено службой патологии юго-западного Лондона /South West London Pathology/).

Переливание крови, бывшей длительное время на хранении, связано с неблагоприятными явлениями

Ведущей причиной смерти после тяжелой травмы является потеря крови. Жертвы с серьезными травмами, которые получают переливания... Читать дальше

Иммунология

посмотреть канал
ИФА-тест PicoAMH измеряет количество антимюллерового гормона (AMH) в крови (фото любезно предоставлено Ansh Labs).

Диагностический тест помогает определить менопаузальный статус

Менопауза - это период в жизни женщины, когда у нее прекращается менструальный цикл и она перестает быть фертильной.... Читать дальше

Патология

посмотреть канал
Диаграмма эволюционных траекторий глиобластом IDH-WT, демонстрирующая типичный путь раннего онкогенеза, инициированного за несколько лет до первоначальной диагностики (фото любезно предоставлено Немецким онкологическим исследовательским центром German Cancer Research Center).

Мутации драйвера развития глиобластомы появляются задолго до постановки диагноза

Глиобластомы являются наиболее распространенной (раковой) первичной опухолью головного мозга у взрослых. В редких случаях... Читать дальше

Лаб. технология

посмотреть канал
Схематическое изображение чипа µLAS с двумя независимыми каналами, приводимыми в действие одинаковым давлением и напряжением. Каждый канал содержит область воронки, которая функционирует для разделения и концентрации ДНК (фото любезно предоставлено Университетом Лозанны).

Генетические методы позволяют быстро диагностировать болезнь Хантингтона

Люди с болезнью Хантингтона страдают от резких движений тела и снижения умственных способностей. Состояние обычно приводит... Читать дальше

Индустрия

посмотреть канал
По прогнозам специалистов, мировой рынок диагностики in vitro будет расти в период между 2017 и 2025 годами и к концу 2025 года достигнет почти 90 миллиардов долларов США (фото любезно предоставлено iStock).

К 2025 году мировой рынок диагностики in vitro достигнет 89 миллиардов долларов США

Мировой рынок диагностики in vitro был оценен в 55,00 миллиардов долларов США в 2016 году и, согласно прогнозам, будет расти... Читать дальше
Copyright © 2000-2019 Globetech Media. All rights reserved.