Мы используем технологию cookie для понимания того, как вы пользуетесь нашим сайтом. Под этим подразумевается персонализированный контент и реклама. Для того, чтобы узнать больше - нажмите сюда. Пользуясь данным сайтом вы подтверждаете согласие с нашей политикой. Политика cookie.
Разделы Партнеры Информация LinkXpress
Вход
Реклама на сайте
ALTO/MARKETING LIMITED

American Gut Project сообщает о результатах работы по исследованию микробиома

Редакция HospiMedica - Россия
Опубликовано 11 Sep 2018
Print article
HiSeq 2500 - мощная система с высокой пропускной способностью (фото любезно предоставлено Illumina).
HiSeq 2500 - мощная система с высокой пропускной способностью (фото любезно предоставлено Illumina).
Проведена большая работа, связанная с исследованием человеческого микробиома с конкретными фенотипами и переменными образа жизни, однако данные из разных проектов оказались сложными для интеграции, а степень микробного и молекулярного разнообразия в стуле человека остается неизвестной.

В ноябре 2012 года было запущено два проекта, American Gut Project (AGP) действовал в рамках сотрудничества между Earth Microbiome Project (EMP) и Human Food Project (HFP) для выявления видов микробиологического разнообразия и микробиомов в естественных условиях посредством самозаявленной группы исследователей-любителей.

Многочисленная команда международных ученых, сотрудничающих с Калифорнийским университетом в Сан-Диего (University of California, San Diego; Ла-Хойя, штат Калифорния, США), исследовала образцы стула у людей в США, Великобритании и десятках других стран. Участники прошли добровольные опросы, связанные с их рационом, образом жизни, состоянием здоровья и историей болезни, в том числе около 1800 человек приняли участие в опросе частоты потребления различных пищевых продуктов на основе картинок.

Команда использовала инструменты MiSeq или HiSeq для секвенирования областей 16S рРНК V4 в образцах, чтобы охарактеризовать их микробный состав. Они также культивировали подмножество образцов, которые были подвергнуты метагеномному шотган-секвенированию с помощью Illumina HiSeq 2500 и профилированию метаболитов с помощью высокоэффективной жидкостной хроматографии и масс-спектрометрии (ВЭЖХ-МС).

В дополнение к выраженному общему микробному разнообразию команда отметила, что различия, обнаруженные между отдельно взятым микробиомом кишечника и соседним, иногда совпадают с различиями, описанными в разных средах для EMP. Команда также смогла профилировать микробный состав кишечника у лиц с психическими расстройствами (депрессия, шизофрения, биполярное расстройство или посттравматическое стрессовое расстройство) или без, выявив микробиомы кишечника, которые сгруппированы отдельно от 125 человек, не страдающих этими заболеваниями.

Когда дело дошло до изучения диеты, ученые обнаружили связи между количеством потребляемых человеком видов растений и их микробным разнообразием кишечника, независимо от того, была ли их общая диета веганской или вегетарианской. Аналогичным образом те, кто сообщал о потреблении разнообразной растительной пищи (30 видов пищи растительного происхождения в неделю или более), были менее склонны переносить микроорганизмы с генами устойчивости к антибиотикам по сравнению с теми, кто потреблял в неделю 10 видов растений или меньше. Возможно, более неожиданным было сравнение 139 лиц, недавно принимавших антибиотики, и 117 лиц, которые не получали антибиотики в течение года или более, что выявило рост метаболомического разнообразия после использования антибиотиков, несмотря на снижение микробного разнообразия.

Доктор философии Дэниел Макдональд (Daniel McDonald), научный директор проекта American Gut Project и ведущий автор исследования, сказал: "Мы наблюдали гораздо большее микробное разнообразие, чем в предыдущих более мелких исследованиях, и это говорит о том, что если мы посмотрим на большее количество населения, то увидим больше разнообразия, что важно для определения границ человеческого микробиома". Исследование было опубликовано 15 мая 2018 года в журнале mSystems.

Ссылки по теме:
Калифорнийский университет в Сан-Диего


Print article

Каналы

Химия

посмотреть канал
Более высокие уровни воспалительного биомаркера растворимого рецептора-1  фактора некроза опухоли (sTNFR-1) связаны с ухудшением функции почек у здоровых взрослых людей (фото любезно предоставлено Enbrel).

Уровни воспалительного маркера связаны с ухудшением функции почек

Рецептор-1 фактора некроза опухоли (TNFR-1), который играет важную роль в дисфункции эндотелиальных клеток и воспалении,... Читать дальше

Молекулярная диагностика

посмотреть канал
Тромбоз глубоких вен (фото предоставлено Wikimedia Commons).

Предложен быстрый метод диагностирования тромбоза глубоких вен

Простой анализ крови был предложен в качестве альтернативы довольно дорогостоящей и интенсивной ультразвуковой процедуре... Читать дальше

Гематология

посмотреть канал
Система HaloPlex обеспечивает быстрый, простой и эффективный анализ представляющих интерес участков генома для большого количества образцов (фото любезно предоставлено Agilent Technologies).

Идентифицированы мутации, которые служат причиной редкого расстройства костного мозга

Ученым удалось пролить свет на вопрос, на протяжении долгих лет волнующий медицинское сообщество: какие мутации ответственны... Читать дальше

Иммунология

посмотреть канал
Микрофотография гистологического препарата печени с многочисленными кистами цестоды гидатидного эхинококка, причины кистозного эхинококкоза, или гидатидной болезни (фото любезно предоставлено Д. Кухарским и К. Кухарской/D. Kucharski, K. Kucharska).

Оценены методы диагностики эхинококкоза мочевого пузыря

Эхинококкоз мочевого пузыря (ЭМП) является одним из наиболее распространенных гельминтозных зоонозов и вызван паразитарным... Читать дальше

Патология

посмотреть канал
Диссеминированные опухолевые клетки (ДОК), выделенные с помощью двойного иммунофлюоресцентного окрашивания (AE1AE3/NR2F1 и AE1AE3/ Ki67), и корреляция между экспрессией Ki67 и NR2F1 (фото предоставлено Школой медицины Икана Медицинского центра Маунт-Синай).

Неактивные диссеминированные опухолевые клетки стратифицированы у пациентов с раком молочной железы

У пациентов с раком молочной железы может наступить рецидив и последующая смерть по причине болезни через много лет после... Читать дальше

Лаб. технология

посмотреть канал
enVision: результаты тестирования обозначаются изменением цвета и могут быть дополнительно проанализированы с помощью приложения для смартфона, что делает его привлекательным в качестве портативного диагностического устройства (фото любезно предоставлено Национальным университетом Сингапура).

Разработан низкозатратный метод диагностики с использованием наноструктур

Обнаружение нуклеиновых кислот возбудителей имеет широкое применение в диагностике и лечении инфекций. Тестирование на вирус... Читать дальше

Индустрия

посмотреть канал
Мировой рынок диагностики IVD, как ожидается, будет расти на 4% ежегодно, до 77,8 миллиардов долларов США к 2023 году (фото любезно предоставлено iStock).

Мировой рынок диагностики in vitro достигнет 77 миллиардов долларов США к 2023 году

Мировой рынок диагностики in vitro (IVD) оценивается в 65 миллиардов долларов США в 2018 году и, как ожидается, будет расти... Читать дальше
Copyright © 2000-2018 Globetech Media. All rights reserved.