Мы используем технологию cookie для понимания того, как вы пользуетесь нашим сайтом. Под этим подразумевается персонализированный контент и реклама. Для того, чтобы узнать больше - нажмите сюда. Пользуясь данным сайтом вы подтверждаете согласие с нашей политикой. Политика cookie.
Разделы Партнеры Информация LinkXpress
Вход
Реклама на сайте
GLOBETECH PUBLISHING LLC

American Gut Project сообщает о результатах работы по исследованию микробиома

Редакция HospiMedica - Россия
Опубликовано 11 Sep 2018
Print article
HiSeq 2500 - мощная система с высокой пропускной способностью (фото любезно предоставлено Illumina).
HiSeq 2500 - мощная система с высокой пропускной способностью (фото любезно предоставлено Illumina).
Проведена большая работа, связанная с исследованием человеческого микробиома с конкретными фенотипами и переменными образа жизни, однако данные из разных проектов оказались сложными для интеграции, а степень микробного и молекулярного разнообразия в стуле человека остается неизвестной.

В ноябре 2012 года было запущено два проекта, American Gut Project (AGP) действовал в рамках сотрудничества между Earth Microbiome Project (EMP) и Human Food Project (HFP) для выявления видов микробиологического разнообразия и микробиомов в естественных условиях посредством самозаявленной группы исследователей-любителей.

Многочисленная команда международных ученых, сотрудничающих с Калифорнийским университетом в Сан-Диего (University of California, San Diego; Ла-Хойя, штат Калифорния, США), исследовала образцы стула у людей в США, Великобритании и десятках других стран. Участники прошли добровольные опросы, связанные с их рационом, образом жизни, состоянием здоровья и историей болезни, в том числе около 1800 человек приняли участие в опросе частоты потребления различных пищевых продуктов на основе картинок.

Команда использовала инструменты MiSeq или HiSeq для секвенирования областей 16S рРНК V4 в образцах, чтобы охарактеризовать их микробный состав. Они также культивировали подмножество образцов, которые были подвергнуты метагеномному шотган-секвенированию с помощью Illumina HiSeq 2500 и профилированию метаболитов с помощью высокоэффективной жидкостной хроматографии и масс-спектрометрии (ВЭЖХ-МС).

В дополнение к выраженному общему микробному разнообразию команда отметила, что различия, обнаруженные между отдельно взятым микробиомом кишечника и соседним, иногда совпадают с различиями, описанными в разных средах для EMP. Команда также смогла профилировать микробный состав кишечника у лиц с психическими расстройствами (депрессия, шизофрения, биполярное расстройство или посттравматическое стрессовое расстройство) или без, выявив микробиомы кишечника, которые сгруппированы отдельно от 125 человек, не страдающих этими заболеваниями.

Когда дело дошло до изучения диеты, ученые обнаружили связи между количеством потребляемых человеком видов растений и их микробным разнообразием кишечника, независимо от того, была ли их общая диета веганской или вегетарианской. Аналогичным образом те, кто сообщал о потреблении разнообразной растительной пищи (30 видов пищи растительного происхождения в неделю или более), были менее склонны переносить микроорганизмы с генами устойчивости к антибиотикам по сравнению с теми, кто потреблял в неделю 10 видов растений или меньше. Возможно, более неожиданным было сравнение 139 лиц, недавно принимавших антибиотики, и 117 лиц, которые не получали антибиотики в течение года или более, что выявило рост метаболомического разнообразия после использования антибиотиков, несмотря на снижение микробного разнообразия.

Доктор философии Дэниел Макдональд (Daniel McDonald), научный директор проекта American Gut Project и ведущий автор исследования, сказал: "Мы наблюдали гораздо большее микробное разнообразие, чем в предыдущих более мелких исследованиях, и это говорит о том, что если мы посмотрим на большее количество населения, то увидим больше разнообразия, что важно для определения границ человеческого микробиома". Исследование было опубликовано 15 мая 2018 года в журнале mSystems.

Ссылки по теме:
Калифорнийский университет в Сан-Диего


Print article
CELLAVISION AB
Mayo Medical Laboratories

Каналы

Химия

посмотреть канал
Срез из гиппокампа пациента с болезнью Альцгеймера, окрашенный антителом к тау-белку (TNT1). Следует обратить внимание на классическую триаду патологий тау при БА, 1) нейрофибриллярные клубки (указатель стрелки), 2) нейропильные нити (стрелки) и 3) нейритическая бляшка (звездочка). Фото любезно предоставлено Мичиганским государственным университетом.

Для выявления болезни Альцгеймера разработан анализ крови на тау-белок

В настоящее время единственный способ прижизненно однозначно диагностировать болезнь Альцгеймера - это провести сканирование... Читать дальше

Молекулярная диагностика

посмотреть канал
В исследовании BabySeq изучалось использование геномного секвенирования у новорожденных, которое может дать родителям более глубокое понимание состояния здоровья их детей (фото любезно предоставлено клиникой Brigham and Women\'s Hospital).

Геномное секвенирование у новорожденных выявляет факторы риска заболеваний

Геномное секвенирование предоставляет множество возможностей клинической помощи новорожденным, но для более широкого и эффективного... Читать дальше

Гематология

посмотреть канал
Система HaloPlex обеспечивает быстрый, простой и эффективный анализ представляющих интерес участков генома для большого количества образцов (фото любезно предоставлено Agilent Technologies).

Идентифицированы мутации, которые служат причиной редкого расстройства костного мозга

Ученым удалось пролить свет на вопрос, на протяжении долгих лет волнующий медицинское сообщество: какие мутации ответственны... Читать дальше

Иммунология

посмотреть канал
Побочные эффекты иммунотерапии (изображение любезно предоставлено Ким Цезарь /Kim Caesar/).

Уровни цитокинов могут предсказать проблемы иммунотерапии

Развитие иммунотерапии, которая мобилизует собственную иммунную систему организма для уничтожения раковых клеток, является... Читать дальше

Патология

посмотреть канал
Струйный принтер создает слои из чернил с золотыми наночастицами, формируя партию биосенсоров, которые могут выявлять в крови белок, характерный для рака молочной железы (фото любезно предоставила Коллин Э. Краузе (Colleen E. Krause), доктор философии).

Создан малоинвазивный биосенсор для диагностики рака молочной железы

Рак молочной железы является наиболее распространенной формой онкологического заболевания у женщин. Обычно для диагностики... Читать дальше

Лаб. технология

посмотреть канал
Университет Британской Колумбии Оканаган

Недорогой биосенсор обеспечивает быструю диагностику бактериальных инфекций

Бактериальная инфекция является распространенной проблемой во всех больницах мира. Каждый час задержки в лечении антибиотиками... Читать дальше

Индустрия

посмотреть канал
Анализаторы иммуноанализов и клинической химии Atellica Solution (фото любезно предоставлено Siemens Healthineers).

Siemens Healthineers и Primary Health Care заключают контракт на диагностику in vitro

Siemens Healthineers (Эрланген, Германия) вступила в стратегическое партнерство с австралийским поставщиком комплексных медицинских... Читать дальше
Copyright © 2000-2019 Globetech Media. All rights reserved.