Разделы Партнеры Информация LinkXpress
Вход
Реклама на сайте
RANDOX LABORATORIES

Анализ методом петлевой изотермической амплификации обнаруживает клонорхоз в образцах человека

Редакция HospiMedica - Россия
Опубликовано 14 Mar 2018
Print article
Чувствительность анализа методом петлевой изотермической амплификации (LAMP) для обнаружения яиц Clonorchis sinensis в экскрементах, экспериментально меченных с известным количеством яиц в десятикратных серийных разведениях от 10 000 яиц (ряд 1) до одного яйца (ряд 5). Фото любезно предоставлено Медицинским исследовательским центром Сеульского национального университета.
Чувствительность анализа методом петлевой изотермической амплификации (LAMP) для обнаружения яиц Clonorchis sinensis в экскрементах, экспериментально меченных с известным количеством яиц в десятикратных серийных разведениях от 10 000 яиц (ряд 1) до одного яйца (ряд 5). Фото любезно предоставлено Медицинским исследовательским центром Сеульского национального университета.
Клонорхоз, распространенный на Дальнем Востоке, представляет серьезную проблему здравоохранения в эндемичных районах. Без лечения зараженные лица могут испытывать серьезные осложнения, такие как образование желчных камней, гнойный холангит и даже холангиокарциному.

Точный диагноз двуустки китайской (Clonorchis sinensis) важен для успешного лечения и контроля инфекции. Для диагностики клонорхоза обычно используется метод Като-Каца (KK) и/или формалин-эфирная концентрационная методика. Тем не менее обследования стула не очень эффективны, так как есть вероятность пропуска случаев заражения.

Ученые из Медицинского исследовательского центра Сеульского национального университета (Seoul National University Medical Research Center; Сеул, Корея) и их коллеги случайно выбрали из набора образцов стула жителей округа Санчхон в Корее, где клонорхоз эндемичен, а факторы риска и частота холангиокарциномы среди жителей были исследованы с 2006 года. Для каждого образца стула были проведены два мазка KK и одна полимеразная цепная реакция (ПЦР) в реальном времени. Для мазка KK 41,7 мг фекалий исследовали с помощью микроскопии и умножали результат на 24, чтобы получить представление о количестве яиц в грамме (EPG) фекалий.

Для обнаружения ДНК Clonorchis sinensis был применен анализ на основе петлевой изотермической амплификации (loop-mediated isothermal amplification - LAMP). Шесть праймеров, нацеленных на восемь местоположений гена субъединицы I цитохрома c-оксидазы C. sinensis, были разработаны для видоспецифической амплификации с использованием анализа LAMP. Амплифицированные продукты LAMP были обнаружены непосредственно либо невооруженным глазом, либо путем помещения реакционной пробирки под ультрафиолетовый (УФ) свет. Кроме того, 5,0 мкл продуктов LAMP были проанализированы электрофорезом на 2%-ном агарозном геле с последующим окрашиванием бромидом этидия и визуализацией в УФ-свете.

Анализ методом LAMP был достаточно чувствительным, чтобы обнаружить всего лишь 100 фг геномной ДНК C. sinensis, а предел обнаружения в 100 мг стула был чрезвычайно низким. Анализ оказался в высокой степени специфичным, потому что перекрестная специфичность с ДНК других гельминтов, простейших или кишечной палочки не наблюдалась. Затем анализ методом LAMP применяли к образцам человеческих фекалий, собранным из района в Корее, где был распространен клонорхоз. Используя образцы, показывающие согласованные результаты как методом Като-Каца, так и ПЦР в реальном времени в качестве стандартов, анализ методом LAMP показал 97,1% чувствительность и 100% специфичность. В образцах стула с количеством яиц более 100 на грамм фекалий чувствительность достигала 100%.

Авторы пришли к выводу, что они разработали высокочувствительный и специфичный анализ методом LAMP для обнаружения ДНК C. sinensis в образцах фекалий человека. Из-за более короткого времени реакции и лучшего визуального рассмотрения и заключения о положительности без использования сложных инструментов анализ методом LAMP будет легче применять в полевых лабораториях, чем ПЦР, в качестве мощного инструмента для более конкретной и надежной диагностики клонорхоза, тем самым улучшая как программы лечения, так и контроль. Исследование было опубликовано 9 октября 2017 года в журнале "Общественная библиотека наук о забытых тропических болезнях" (Public Library of Science Neglected Tropical Diseases).

Ссылки по теме:
Медицинский исследовательский центр Сеульского национального университета


Print article

Каналы

Химия

посмотреть канал
Набор для твердофазного иммуноферментного анализа (ELISA) олигомеров человеческого β-амилоида (фото предоставлено IBL International).

Биомаркер цереброспинальной жидкости для определения болезни Альцгеймера оценен для использования в клинических условиях

Анализ цереброспинальной жидкости (ЦСЖ) является одним из ключевых инструментов для современной дифференциальной диагностики деменций.... Читать дальше

Молекулярная диагностика

посмотреть канал
При эпидемии болезни легионеров необходимо максимально быстро и точно выявить источник патогенов, чтобы предотвратить дальнейшее распространение инфекций. В настоящее время исследователи разработали экспресс-тест, который идентифицирует Legionella pneumophila менее чем за час. На фотографии показано использование чипа LegioTyper с MCR-платформой для анализа микрочипов (изображение любезно предоставлено Йонасом Бемцем (Jonas Bemetz), Мюнхенский технический университет).

Предложен способ быстрого обнаружения легионелл для систем водоснабжения

Быстрый анализ (время выполнения занимает примерно 1 час) с использованием ДНК-микрочипов сможет заменить классические методы... Читать дальше

Гематология

посмотреть канал
Иммунохимический анализатор Architect i2000SR (фото любезно предоставлено Abbott Diagnostics).

Синдром хронической усталости связан с уровнями гормонов щитовидной железы

Синдром хронической усталости (СХУ) является распространенным заболеванием, отмеченным длительными периодами слабости, усталости... Читать дальше

Иммунология

посмотреть канал
Новый тест p2PSA Access Hybritech, входящий в индекс здоровья простаты (phi) (фото любезно предоставлено Beckman Coulter).

После проведения тестирования на индекс здоровья простаты назначается меньшее количество биопсий предстательной железы

Рак предстательной железы является третьей ведущей причиной смерти от рака у мужчин, причем каждому седьмому ставится диагноз... Читать дальше

Патология

посмотреть канал
Внеклеточные везикулы (красные) высвобождаются из опухоли пациента и захватываются на поверхности EVHB-Chip (фото любезно предоставлено профессором Шеннон Стотт, доктором философии).

Микрожидкостное устройство способно захватывать опухолевые специфические внеклеточные везикулы

Разработано микрожидкостное устройство, которое с высокой специфичностью может захватывать внеклеточные везикулы из глиобластомы,... Читать дальше

Лаб. технология

посмотреть канал
Чип μCENSE с настольной платформой для центрифугирования на заднем плане (фото любезно предоставлено доктором философии Джо Чуан Йо (Joo Chuan Yeo)).

Платформа жидкой биопсии изолирует циркулирующие биомаркеры заболеваний

Создана новая платформа с возможностью извлечения микроскопических циркулирующих биомаркеров заболеваний из крови пациента.... Читать дальше

Индустрия

посмотреть канал
Siemens Healthineеrs заключила соглашение о приобретении Fast Track Diagnostics (фото любезно предоставлено iStock).

Siemens Healthineers приобретает Fast Track Diagnostics

Siemens Healthineers (Эрланген, Германия) заключила соглашение о приобретении Fast Track Diagnostics (Эш-сюр-Альзетт, Люксембург),... Читать дальше
Copyright © 2000-2018 Globetech Media. All rights reserved.