Мы используем технологию cookie для понимания того, как вы пользуетесь нашим сайтом. Под этим подразумевается персонализированный контент и реклама. Для того, чтобы узнать больше - нажмите сюда. Пользуясь данным сайтом вы подтверждаете согласие с нашей политикой. Политика cookie.

Please note that the LabMedica website is also available in a complete English version
Разделы Партнеры Информация LinkXpress
Вход
Реклама на сайте
GLOBETECH PUBLISHING LLC

Мобильное Приложение




Времяпролётная масс-спектрометрия с лазерной ионизацией и десорбцией из жидкой матрицы поможет идентифицировать питиоз

Редакция HospiMedica - Россия
Опубликовано 17 Oct 2018
Print article
Времяпролётный масс-спектрометр с лазерной ионизацией и десорбцией из жидкой матрицы (фото любезно предоставлено Bruker Daltonics).
Времяпролётный масс-спектрометр с лазерной ионизацией и десорбцией из жидкой матрицы (фото любезно предоставлено Bruker Daltonics).
Питиоз - опасное для жизни инфекционное заболевание, вызываемое оомицетом Pythium insidiosum. Болезнь все чаще регистрируется во всем мире, и большинство пациентов с питиозом подвергаются хирургическому удалению инфицированного органа.

В последнее десятилетие появился новый мощный диагностический инструмент для упрощения клинической идентификации многих патогенных микроорганизмов, включая бактерии и грибы, – времяпролётная масс-спектрометрия с лазерной ионизацией и десорбцией из жидкой матрицы (matrix-assisted laser desorption ionization–time of flight mass spectrometry - MALDI-TOF MS).

Ученые из Университета Махидола (Mahidol University; Бангкок, Таиланд) выделили в общей сложности 13 штаммов P. insidiosum от восьми человек и пяти животных с питиозом из разных географических местоположений; полученные штаммы были разделены на две группы. Все организмы поддерживались на сабуро-декстрозном агаре при 25 °С. Несколько небольших частей колонии каждого организма были перенесены в 50-миллилитровую колбу, содержащую 10 мл сабуро-декстрозного бульона, и инкубированы при 37 °С в течение одной недели, прежде чем грибковый материал для экстракции белка был собран.

Белок извлекался из организмов и экстрагированный белоксодержащий супернатант наносился на чистую пластину из шлифованной стали в 40 копиях (для получения базы данных MALDI-TOF MS P. insidiosum) или 5 копиях (для оценки MALDI-TOF MS на идентификацию P. insidiosum), после он был просушен на воздухе при комнатной температуре и покрыт 0,5 мкл матричного раствора. Шаблоны геномной ДНК (gDNA) экстрагировались из организмов и подвергались мультиплексной полимеразной цепной реакции (ПЦР) на основе точечного нуклеотидного полиморфизма.

Ученые сообщили, что MALDI-TOF MS точно идентифицировала все 13 штаммов P. insidiosum, проверенные на уровне видов. Масс-спектры P. insidiosum не соответствовали каким-либо другим микроорганизмам, включая грибы (то есть виды Aspergillus, виды Fusarium и грибковые виды класса Zygomycetes), которые имеют сходные микроскопические морфологии с этим оомицетом. Методы биотипирования на основе секвенирования MALDI-TOF MS и rDNA согласованно классифицировали P. insidiosum на три группы: Clade-I (американские штаммы), II (азиатские и австралийские штаммы) и III (в основном тайские штаммы).

Авторы пришли к выводу, что MALDI-TOF MS была успешно использована для идентификации и биотипирования P. insidiosum. Полученная база масс-спектров позволяет клиническим микробиологическим лабораториям, хорошо оснащенным масс-спектрометром MALDI-TOF, удобно идентифицировать P. insidiosum, не требуя каких-либо патоген-специфических реагентов (т.е. антигены, антитела или праймеры). Исследование было опубликовано 6 сентября 2018 года в Международном журнале инфекционных заболеваний (International Journal of Infectious Diseases).

Ссылки по теме:
Университет Махидола


Print article
Mayo Medical Laboratories

Каналы

Химия

посмотреть канал
Гистопатология неалкогольной жировой болезни печени с паттерном фиброза вокруг гепатоцитов (фото предоставлено университетской больницей Marqués de Valdecilla).

Показатель С-пептида связан с воспалительным прогрессированием НАЖБП

Неалкогольная жировая болезнь печени (НАЖБП) характеризуется аномальным накоплением жира в печени, что обусловлено причинами,... Читать дальше

Молекулярная диагностика

посмотреть канал
Набор E.Z.N.A изолирует ДНК из образцов стула с использованием спин-колонок (фото любезно предоставлено Omega Bio-tek).

Риск диабета типа 1 отражен в микробиоме кишечника

Сахарный диабет 1 типа (T1D) - это аутоиммунное заболевание, характеризующееся разрушением инсулин-продуцирующих β-клеток... Читать дальше

Гематология

посмотреть канал
Жертвы с серьезными травмами, которые получают переливания единиц эритроцитарной массы, хранящихся в течение 22 дней или больше, могут столкнуться с повышенным риском смерти в течение 24 часов (фото любезно предоставлено службой патологии юго-западного Лондона /South West London Pathology/).

Переливание крови, бывшей длительное время на хранении, связано с неблагоприятными явлениями

Ведущей причиной смерти после тяжелой травмы является потеря крови. Жертвы с серьезными травмами, которые получают переливания... Читать дальше

Иммунология

посмотреть канал
Химический анализатор RX Daytona – компактный, полностью автоматизированный настольный клинический химический анализатор, идеально подходящий для лабораторий с малой и средней пропускной способностью (фото любезно предоставлено Randox Laboratories).

Мочевые биомаркеры позволяют диагностировать серьезные аллергические реакции почек

Острый интерстициальный нефрит (ОИН) представляет собой состояние, характеризующееся воспалением и отеком почечных канальцев... Читать дальше

Лаб. технология

посмотреть канал
(A) и (B) – микрофотографии слоев устройства; (C) – пресс-форма, готовая к разливке, и (D) – чип, установленный на предметном стекле. Фото любезно предоставлено Государственным университетом Сан-Диего.

Микрофлюидное устройство изолирует кластеры циркулирующих опухолевых клеток

Тремя основными проблемами при лечении рака являются метастазы, рецидивы и приобретенная резистентность к терапии.... Читать дальше

Патология

посмотреть канал
Набор для исследования с использованием микропанели The Quick-Ray Manual Tissue Microarrayer Set (фото любезно предоставлено компанией Unitma).

Проведён сравнительный анализ диагностических панелей по выявлению рака легких

Рак легких является ведущей причиной смерти от онкологических заболеваний. Немелкоклеточный рак легкого - наиболее распространенный... Читать дальше

Индустрия

посмотреть канал
По прогнозам специалистов, мировой рынок диагностики in vitro будет расти в период между 2017 и 2025 годами и к концу 2025 года достигнет почти 90 миллиардов долларов США (фото любезно предоставлено iStock).

К 2025 году мировой рынок диагностики in vitro достигнет 89 миллиардов долларов США

Мировой рынок диагностики in vitro был оценен в 55,00 миллиардов долларов США в 2016 году и, согласно прогнозам, будет расти... Читать дальше
Copyright © 2000-2019 Globetech Media. All rights reserved.