Мы используем технологию cookie для понимания того, как вы пользуетесь нашим сайтом. Под этим подразумевается персонализированный контент и реклама. Для того, чтобы узнать больше - нажмите сюда. Пользуясь данным сайтом вы подтверждаете согласие с нашей политикой. Политика cookie.
Please note that the LabMedica website is also available in a complete English version
Разделы Партнеры Информация LinkXpress
Вход
Реклама на сайте
GLOBETECH PUBLISHING LLC

Пронализирована функциональная геномная природа острого миелоидного лейкоза

Редакция HospiMedica - Россия
Опубликовано 29 Jan 2019
Print article
Система HiSeq 2500 представляет собой мощную высокопроизводительную систему секвенирования (фото любезно предоставлено Illumina).
Система HiSeq 2500 представляет собой мощную высокопроизводительную систему секвенирования (фото любезно предоставлено Illumina).
Острый миелоидный лейкоз - это рак миелоидной линии клеток крови, характеризующийся быстрым ростом аномальных клеток, которые накапливаются в костном мозге и крови и препятствуют развитию нормальных клеток крови.

Реализация таргетной терапии острого миелоидного лейкоза (ОМЛ) была трудноосуществимой из-за сложных паттернов мутаций как в рамках организма одного пациента, так и в их совокупности, а также из-за нехватки фармакологических препаратов для большинства мутационных событий.

Ученые из Орегонского Университета науки и здоровья (Oregon Health & Science University; Портленд, штат Орегон, США) использовали секвенирование экзома, секвенирование РНК и/или тестирование ex vivo на лекарственную чувствительность для профилирования до 672 образцов опухолей от 562 пациентов с ОМЛ. В дополнение к выявлению повторяющихся мутаций, ранее не описанных в заболевании, были обнаружены паттерны ответа на лечение, которые соответствовали определенным комбинациям мутаций или сигнатурам экспрессии генов.

В рамках программы под названием "Beat AML" команда провела экзомное секвенирование спаренных концов с помощью аппарата Illumina HiSeq 2500 на 622 образцах опухолей. Было также выполнено секвенирование РНК на 451 образце опухоли от 411 пациентов с ОМЛ и тестирование чувствительности к лекарственным препаратам с 122 препаратами на 409 образцах опухоли от 363 пациентов с ОМЛ.

Команда раскрыла профили транскриптома, связанные с частыми мутациями опухоли или подмножествами опухолей со специфическими цитогенетическими особенностями, а также с комбинациями экспрессии генов и мутаций, которые присутствовали, когда опухоли реагировали или не реагировали на различные лекарства. В тех случаях, когда устойчивость к лекарственным средствам была распространена в опухолях, содержащих мутации в TP53, NRAS, KRAS, IDH1 или в гене, кодирующем регулятор транскрипции ASXL1, отмечалось, что опухоли, положительные по мутациям IDH2, имели тенденцию к чувствительности к лекарствам. Анализ команды также выявил специфическую чувствительность к лекарственным средствам, соответствующую целевым методам лечения, таким как MAP-киназа, PIK3C, mTOR или ингибиторы JAK. Эти и другие данные доступны другим ученым в режиме онлайн при помощи просмотрщика данных Vizome.

Доктор философии Джеффри Тайнер (Jeffrey Tyner), адъюнкт-профессор и ведущий автор исследования, сказал: "Наш набор данных может быть полезным, чтобы увидеть, соответствует ли эта конкретная генная мутация определенной чувствительности к лекарственным препаратам. Мы считаем, что такой набор данных поможет врачам легче находить решение конкретным проблемам". Исследование было опубликовано 17 октября 2018 года в журнале Nature.

Ссылки по теме:
Орегонский университет науки и здоровья


Print article

Каналы

Химия

посмотреть канал
Аспирантка использует новый диагностический инструмент, измеряющий метаболическую активность в крови, что позволяет отличить фибромиалгию от других состояний с хронической болью с почти 100% точностью (фото любезно предоставлено Университетом штата Огайо).

Метод метаболического фингерпринтинга позволяет диагностировать фибромиалгию

Фибромиалгия является наиболее распространенной причиной хронической генерализованной боли в США и большей частью затрагивает женщин.... Читать дальше

Молекулярная диагностика

посмотреть канал
Мутационная нагрузка опухоли, определенная целенаправленным секвенированием нового поколения, предсказывает эффективность ингибиторов контрольных точек иммунного ответа для лечения рака (фото любезно предоставлено Онкологическим институтом Рутгерса).

Мутационная нагрузка опухоли прогнозирует выживание после иммунотерапии

Изучение тысяч случаев прогрессирующего рака позволяет предположить способ определения тех опухолей, которые будут с наибольшей... Читать дальше

Иммунология

посмотреть канал
ИФА-тест PicoAMH измеряет количество антимюллерового гормона (AMH) в крови (фото любезно предоставлено Ansh Labs).

Диагностический тест помогает определить менопаузальный статус

Менопауза - это период в жизни женщины, когда у нее прекращается менструальный цикл и она перестает быть фертильной.... Читать дальше

Микробиология

посмотреть канал
Цифровая капельная ПЦР-система QX200 (фото любезно предоставлено Bio-Rad).

Олигобациллярная лепра может быть диагностирована с помощью цифрового ПЦР-анализа

Проказа, или болезнь Хансена, является хроническим бактериальным заболеванием, вызываемым Mycobacterium leprae.... Читать дальше

Патология

посмотреть канал
Гистопатология гепатоцеллюлярной карциномы: инфильтрат мононуклеарных воспалительных клеток выходит из портальных зон и разрушает сдерживающий слой из гепатоцитов, подвергающихся апоптозу, так называемый интерфейсный гепатит хронического активного гепатита. В данном случае поверхностный антиген гепатита В (HBsAg) и антитела к сердцевинному антигену гепатита В (HBcAb) были положительными. Фото любезно предоставлено Медицинской школой Университета Юты.

Вирус-ассоциированный рак печени может быть выявлен с помощью анализа крови

Вирусная инфекция, вызванная вирусом гепатита С (HCV) или вирусом гепатита B (HBV), является основной причиной рака печени... Читать дальше

Лаб. технология

посмотреть канал
Схематическое изображение чипа µLAS с двумя независимыми каналами, приводимыми в действие одинаковым давлением и напряжением. Каждый канал содержит область воронки, которая функционирует для разделения и концентрации ДНК (фото любезно предоставлено Университетом Лозанны).

Генетические методы позволяют быстро диагностировать болезнь Хантингтона

Люди с болезнью Хантингтона страдают от резких движений тела и снижения умственных способностей. Состояние обычно приводит... Читать дальше

Индустрия

посмотреть канал
По прогнозам специалистов, мировой рынок диагностики in vitro будет расти в период между 2017 и 2025 годами и к концу 2025 года достигнет почти 90 миллиардов долларов США (фото любезно предоставлено iStock).

К 2025 году мировой рынок диагностики in vitro достигнет 89 миллиардов долларов США

Мировой рынок диагностики in vitro был оценен в 55,00 миллиардов долларов США в 2016 году и, согласно прогнозам, будет расти... Читать дальше
Copyright © 2000-2019 Globetech Media. All rights reserved.