Мы используем технологию cookie для понимания того, как вы пользуетесь нашим сайтом. Под этим подразумевается персонализированный контент и реклама. Для того, чтобы узнать больше - нажмите сюда. Пользуясь данным сайтом вы подтверждаете согласие с нашей политикой. Политика cookie.
Please note that the LabMedica website is also available in a complete English version
Разделы Партнеры Информация LinkXpress
Вход
Реклама на сайте
RANDOX LABORATORIES

Мобильное Приложение




Секвенирование позволяет точно согласовывать переливание крови

Редакция HospiMedica - Россия
Опубликовано 22 Aug 2018
Print article
Пакет для трансфузии, предназначенный для второй группы крови, резус-отрицательный (фото любезно предоставлено Sherry Yates Young).
Пакет для трансфузии, предназначенный для второй группы крови, резус-отрицательный (фото любезно предоставлено Sherry Yates Young).
Существует более 300 известных антигенов эритроцитов и 33 антигена тромбоцитов, которые различаются у каждого отдельного человека. Сенсибилизация к антигенам является серьезным осложнением, которое может возникнуть в пренатальной медицине и после переливания крови, особенно для пациентов, которым требуются множественные переливания.

Хотя тестирование на совместимость до переливания в значительной степени зависит от серологических методов, реагенты для многих антигенов недоступны. Были использованы методы, основанные на массивах одиночного нуклеотидного полиморфизма (ОНП), но типирование для ABO и резус-фактора, наиболее важных систем групп крови, не может быть выполнено с помощью ОНП-типирования.

Ученые из Женской больницы Бригама (Бостон, штат Массачусетс, США) и их коллеги создали базу данных о молекулярных изменениях в антигенах эритроцитов и тромбоцитов и разработали автоматизированный алгоритм антигенного типирования, основанный на полногеномном секвенировании (bloodTyper). Этот алгоритм был итерационно улучшен для решения проблемы двусмысленности цис-транс-гаплотипов и гомологичных выравниваний генов. Данные для определения цельного генома от 110 участников MedSeq (глубина секвенирования 30×) использовались для первоначальной проверки качества крови через сравнение с традиционными методами серологии и ОНП для набора 38 антигенов эритроцитов в 12 системах групп крови и 22 антигенов человеческих тромбоцитов. bloodTyper был дополнительно подтвержден данными полногеномного секвенирования от 200 участников INTERVAL (глубина секвенирования 15×) с серологическими сравнениями.

Ученые итерационно улучшили bloodTyper, сравнив результаты типирования с традиционным серологическим и ОНП-типированием в трех раундах тестирования. Первоначальный алгоритм типирования полногеномного секвенирования был на 99,5% согласован по первым 20 геномам MedSeq. Решение разногласий привело к разработке улучшенного алгоритма, который на 99,8% согласован с остальными 90 геномами MedSeq. Дополнительные модификации привели к окончательному варианту алгоритма, который был согласован на 99,2% по 200 геномам INTERVAL или 99,9% после корректировки для более низкой глубины охвата.

Авторы пришли к выводу, что благодаря более точному антигенному сопоставлению пациентов с донорами крови антигенное типирование, основанное на полногеномном секвенировании, обеспечивает новый подход к улучшению результатов переливания с возможностью трансформации практики трансфузионной медицины. Доктор философии Конни М. Уэстхофф (Connie M. Westhoff), сотрудник Нью-Йоркского центра крови (Нью-Йорк, штат Нью-Йорк, США) и один из первых авторов исследования, сказала: "Этот подход может быть одним из первых обычных клинических применений геномики для медицинского ухода за пациентами, нуждающимися в переливании крови. Это может предотвратить серьезные или даже смертельные осложнения, потому что когда пациенты сенсибилизированы, у них имеется пожизненный риск гемолитической реакции при переливании крови, особенно если переливание крови требуется в чрезвычайной ситуации". Исследование было опубликовано 17 мая 2018 года в журнале The Lancet Hematology.

Ссылки по теме:
Женская больница Бригама
Нью-Йоркский центр крови



Print article

Каналы

Химия

посмотреть канал
Схема 3D-печатного устройства для электрофореза на микрочипе, которое достаточно чувствительно для обнаружения трех сывороточных биомаркеров, связанных с преждевременными родами (фото предоставлено Университетом Бригама Янга).

Устройство, напечатанное на 3D-принтере, определяет биомаркеры, связанные с преждевременными родами

Преждевременные роды (ПВР), определяемые как роды до 37-й недели беременности, являются одним из самых распространенных осложнений... Читать дальше

Молекулярная диагностика

посмотреть канал
Гистопатология колоректальной карциномы: пример умеренно дифференцированной аденокарциномы, показывающий сложные железистые структуры в десмопластической строме (фото любезно предоставлено Медицинской школой Дэвида Геффена при Калифорнийском университете (David Geffen School of Medicine at the University of California)).

ЦоДНК предсказывает рецидив неметастатического колоректального рака

Колоректальный рак (КРР), также известный как рак кишечника и рак толстой кишки, является развитием рака толстой кишки или... Читать дальше

Иммунология

посмотреть канал
ИФА-тест PicoAMH измеряет количество антимюллерового гормона (AMH) в крови (фото любезно предоставлено Ansh Labs).

Диагностический тест помогает определить менопаузальный статус

Менопауза - это период в жизни женщины, когда у нее прекращается менструальный цикл и она перестает быть фертильной.... Читать дальше

Микробиология

посмотреть канал
Цифровая капельная ПЦР-система QX200 (фото любезно предоставлено Bio-Rad).

Олигобациллярная лепра может быть диагностирована с помощью цифрового ПЦР-анализа

Проказа, или болезнь Хансена, является хроническим бактериальным заболеванием, вызываемым Mycobacterium leprae.... Читать дальше

Патология

посмотреть канал
Лимфатический узел с почти полной заменой метастатической меланомой. Коричневый пигмент является очаговым отложением меланина (фото любезно предоставлено доктором медицины Габриэлем Капонетти (Gabriel Caponetti)).

Анализ крови определяет эффективность лечения агрессивного рака

Анализы крови, отслеживающие количество опухолевых ДНК, могут определить, насколько хорошо проходит лечение у пациентов с... Читать дальше

Лаб. технология

посмотреть канал
Схематическое изображение чипа µLAS с двумя независимыми каналами, приводимыми в действие одинаковым давлением и напряжением. Каждый канал содержит область воронки, которая функционирует для разделения и концентрации ДНК (фото любезно предоставлено Университетом Лозанны).

Генетические методы позволяют быстро диагностировать болезнь Хантингтона

Люди с болезнью Хантингтона страдают от резких движений тела и снижения умственных способностей. Состояние обычно приводит... Читать дальше

Индустрия

посмотреть канал
По прогнозам специалистов, мировой рынок диагностики in vitro будет расти в период между 2017 и 2025 годами и к концу 2025 года достигнет почти 90 миллиардов долларов США (фото любезно предоставлено iStock).

К 2025 году мировой рынок диагностики in vitro достигнет 89 миллиардов долларов США

Мировой рынок диагностики in vitro был оценен в 55,00 миллиардов долларов США в 2016 году и, согласно прогнозам, будет расти... Читать дальше
Copyright © 2000-2019 Globetech Media. All rights reserved.