Мы используем технологию cookie для понимания того, как вы пользуетесь нашим сайтом. Под этим подразумевается персонализированный контент и реклама. Для того, чтобы узнать больше - нажмите сюда. Пользуясь данным сайтом вы подтверждаете согласие с нашей политикой. Политика cookie.
Разделы Партнеры Информация LinkXpress
Вход
Реклама на сайте
ALTO/MARKETING LIMITED

Секвенирование позволяет точно согласовывать переливание крови

Редакция HospiMedica - Россия
Опубликовано 22 Aug 2018
Print article
Пакет для трансфузии, предназначенный для второй группы крови, резус-отрицательный (фото любезно предоставлено Sherry Yates Young).
Пакет для трансфузии, предназначенный для второй группы крови, резус-отрицательный (фото любезно предоставлено Sherry Yates Young).
Существует более 300 известных антигенов эритроцитов и 33 антигена тромбоцитов, которые различаются у каждого отдельного человека. Сенсибилизация к антигенам является серьезным осложнением, которое может возникнуть в пренатальной медицине и после переливания крови, особенно для пациентов, которым требуются множественные переливания.

Хотя тестирование на совместимость до переливания в значительной степени зависит от серологических методов, реагенты для многих антигенов недоступны. Были использованы методы, основанные на массивах одиночного нуклеотидного полиморфизма (ОНП), но типирование для ABO и резус-фактора, наиболее важных систем групп крови, не может быть выполнено с помощью ОНП-типирования.

Ученые из Женской больницы Бригама (Бостон, штат Массачусетс, США) и их коллеги создали базу данных о молекулярных изменениях в антигенах эритроцитов и тромбоцитов и разработали автоматизированный алгоритм антигенного типирования, основанный на полногеномном секвенировании (bloodTyper). Этот алгоритм был итерационно улучшен для решения проблемы двусмысленности цис-транс-гаплотипов и гомологичных выравниваний генов. Данные для определения цельного генома от 110 участников MedSeq (глубина секвенирования 30×) использовались для первоначальной проверки качества крови через сравнение с традиционными методами серологии и ОНП для набора 38 антигенов эритроцитов в 12 системах групп крови и 22 антигенов человеческих тромбоцитов. bloodTyper был дополнительно подтвержден данными полногеномного секвенирования от 200 участников INTERVAL (глубина секвенирования 15×) с серологическими сравнениями.

Ученые итерационно улучшили bloodTyper, сравнив результаты типирования с традиционным серологическим и ОНП-типированием в трех раундах тестирования. Первоначальный алгоритм типирования полногеномного секвенирования был на 99,5% согласован по первым 20 геномам MedSeq. Решение разногласий привело к разработке улучшенного алгоритма, который на 99,8% согласован с остальными 90 геномами MedSeq. Дополнительные модификации привели к окончательному варианту алгоритма, который был согласован на 99,2% по 200 геномам INTERVAL или 99,9% после корректировки для более низкой глубины охвата.

Авторы пришли к выводу, что благодаря более точному антигенному сопоставлению пациентов с донорами крови антигенное типирование, основанное на полногеномном секвенировании, обеспечивает новый подход к улучшению результатов переливания с возможностью трансформации практики трансфузионной медицины. Доктор философии Конни М. Уэстхофф (Connie M. Westhoff), сотрудник Нью-Йоркского центра крови (Нью-Йорк, штат Нью-Йорк, США) и один из первых авторов исследования, сказала: "Этот подход может быть одним из первых обычных клинических применений геномики для медицинского ухода за пациентами, нуждающимися в переливании крови. Это может предотвратить серьезные или даже смертельные осложнения, потому что когда пациенты сенсибилизированы, у них имеется пожизненный риск гемолитической реакции при переливании крови, особенно если переливание крови требуется в чрезвычайной ситуации". Исследование было опубликовано 17 мая 2018 года в журнале The Lancet Hematology.

Ссылки по теме:
Женская больница Бригама
Нью-Йоркский центр крови



Print article

Каналы

Химия

посмотреть канал
Более высокие уровни воспалительного биомаркера растворимого рецептора-1  фактора некроза опухоли (sTNFR-1) связаны с ухудшением функции почек у здоровых взрослых людей (фото любезно предоставлено Enbrel).

Уровни воспалительного маркера связаны с ухудшением функции почек

Рецептор-1 фактора некроза опухоли (TNFR-1), который играет важную роль в дисфункции эндотелиальных клеток и воспалении,... Читать дальше

Молекулярная диагностика

посмотреть канал
Тромбоз глубоких вен (фото предоставлено Wikimedia Commons).

Предложен быстрый метод диагностирования тромбоза глубоких вен

Простой анализ крови был предложен в качестве альтернативы довольно дорогостоящей и интенсивной ультразвуковой процедуре... Читать дальше

Иммунология

посмотреть канал
Микрофотография гистологического препарата печени с многочисленными кистами цестоды гидатидного эхинококка, причины кистозного эхинококкоза, или гидатидной болезни (фото любезно предоставлено Д. Кухарским и К. Кухарской/D. Kucharski, K. Kucharska).

Оценены методы диагностики эхинококкоза мочевого пузыря

Эхинококкоз мочевого пузыря (ЭМП) является одним из наиболее распространенных гельминтозных зоонозов и вызван паразитарным... Читать дальше

Микробиология

посмотреть канал
Тест NADAL Malaria 4 (быстрый диагностический тест). Фото любезно предоставлено Налом фон Минденом /Nal von Minden.

Проведено сравнение диагностических методов по обнаружению малярии

Основной стратегией борьбы с малярией является быстрая и точная диагностика, за которой следует действенное лечение.... Читать дальше

Патология

посмотреть канал
Диссеминированные опухолевые клетки (ДОК), выделенные с помощью двойного иммунофлюоресцентного окрашивания (AE1AE3/NR2F1 и AE1AE3/ Ki67), и корреляция между экспрессией Ki67 и NR2F1 (фото предоставлено Школой медицины Икана Медицинского центра Маунт-Синай).

Неактивные диссеминированные опухолевые клетки стратифицированы у пациентов с раком молочной железы

У пациентов с раком молочной железы может наступить рецидив и последующая смерть по причине болезни через много лет после... Читать дальше

Лаб. технология

посмотреть канал
enVision: результаты тестирования обозначаются изменением цвета и могут быть дополнительно проанализированы с помощью приложения для смартфона, что делает его привлекательным в качестве портативного диагностического устройства (фото любезно предоставлено Национальным университетом Сингапура).

Разработан низкозатратный метод диагностики с использованием наноструктур

Обнаружение нуклеиновых кислот возбудителей имеет широкое применение в диагностике и лечении инфекций. Тестирование на вирус... Читать дальше

Индустрия

посмотреть канал
Мировой рынок диагностики IVD, как ожидается, будет расти на 4% ежегодно, до 77,8 миллиардов долларов США к 2023 году (фото любезно предоставлено iStock).

Мировой рынок диагностики in vitro достигнет 77 миллиардов долларов США к 2023 году

Мировой рынок диагностики in vitro (IVD) оценивается в 65 миллиардов долларов США в 2018 году и, как ожидается, будет расти... Читать дальше
Copyright © 2000-2018 Globetech Media. All rights reserved.