Мы используем технологию cookie для понимания того, как вы пользуетесь нашим сайтом. Под этим подразумевается персонализированный контент и реклама. Для того, чтобы узнать больше - нажмите сюда. Пользуясь данным сайтом вы подтверждаете согласие с нашей политикой. Политика cookie.
Разделы Партнеры Информация LinkXpress
Вход
Реклама на сайте
SIGMA ALDRICH CORP.

Секвенирование позволяет точно согласовывать переливание крови

Редакция HospiMedica - Россия
Опубликовано 22 Aug 2018
Print article
Пакет для трансфузии, предназначенный для второй группы крови, резус-отрицательный (фото любезно предоставлено Sherry Yates Young).
Пакет для трансфузии, предназначенный для второй группы крови, резус-отрицательный (фото любезно предоставлено Sherry Yates Young).
Существует более 300 известных антигенов эритроцитов и 33 антигена тромбоцитов, которые различаются у каждого отдельного человека. Сенсибилизация к антигенам является серьезным осложнением, которое может возникнуть в пренатальной медицине и после переливания крови, особенно для пациентов, которым требуются множественные переливания.

Хотя тестирование на совместимость до переливания в значительной степени зависит от серологических методов, реагенты для многих антигенов недоступны. Были использованы методы, основанные на массивах одиночного нуклеотидного полиморфизма (ОНП), но типирование для ABO и резус-фактора, наиболее важных систем групп крови, не может быть выполнено с помощью ОНП-типирования.

Ученые из Женской больницы Бригама (Бостон, штат Массачусетс, США) и их коллеги создали базу данных о молекулярных изменениях в антигенах эритроцитов и тромбоцитов и разработали автоматизированный алгоритм антигенного типирования, основанный на полногеномном секвенировании (bloodTyper). Этот алгоритм был итерационно улучшен для решения проблемы двусмысленности цис-транс-гаплотипов и гомологичных выравниваний генов. Данные для определения цельного генома от 110 участников MedSeq (глубина секвенирования 30×) использовались для первоначальной проверки качества крови через сравнение с традиционными методами серологии и ОНП для набора 38 антигенов эритроцитов в 12 системах групп крови и 22 антигенов человеческих тромбоцитов. bloodTyper был дополнительно подтвержден данными полногеномного секвенирования от 200 участников INTERVAL (глубина секвенирования 15×) с серологическими сравнениями.

Ученые итерационно улучшили bloodTyper, сравнив результаты типирования с традиционным серологическим и ОНП-типированием в трех раундах тестирования. Первоначальный алгоритм типирования полногеномного секвенирования был на 99,5% согласован по первым 20 геномам MedSeq. Решение разногласий привело к разработке улучшенного алгоритма, который на 99,8% согласован с остальными 90 геномами MedSeq. Дополнительные модификации привели к окончательному варианту алгоритма, который был согласован на 99,2% по 200 геномам INTERVAL или 99,9% после корректировки для более низкой глубины охвата.

Авторы пришли к выводу, что благодаря более точному антигенному сопоставлению пациентов с донорами крови антигенное типирование, основанное на полногеномном секвенировании, обеспечивает новый подход к улучшению результатов переливания с возможностью трансформации практики трансфузионной медицины. Доктор философии Конни М. Уэстхофф (Connie M. Westhoff), сотрудник Нью-Йоркского центра крови (Нью-Йорк, штат Нью-Йорк, США) и один из первых авторов исследования, сказала: "Этот подход может быть одним из первых обычных клинических применений геномики для медицинского ухода за пациентами, нуждающимися в переливании крови. Это может предотвратить серьезные или даже смертельные осложнения, потому что когда пациенты сенсибилизированы, у них имеется пожизненный риск гемолитической реакции при переливании крови, особенно если переливание крови требуется в чрезвычайной ситуации". Исследование было опубликовано 17 мая 2018 года в журнале The Lancet Hematology.

Ссылки по теме:
Женская больница Бригама
Нью-Йоркский центр крови



Print article

Каналы

Химия

посмотреть канал
Новое исследование показывает, что ожирение, которое влияет на печень, может сыграть определенную роль в развитии болезни Альцгеймера и деменции в отдаленном будущем (фото предоставлено Deposit Photos).

На риск развития болезни Альцгеймера влияет состояние печени и диета

Сниженные уровни плазмалогенов имеют связь с повышенным риском болезни Альцгеймера. Плазмалогены вырабатываются в печени... Читать дальше

Молекулярная диагностика

посмотреть канал
Тромбоз глубоких вен (фото предоставлено Wikimedia Commons).

Предложен быстрый метод диагностирования тромбоза глубоких вен

Простой анализ крови был предложен в качестве альтернативы довольно дорогостоящей и интенсивной ультразвуковой процедуре... Читать дальше

Иммунология

посмотреть канал
Ревматоидный артрит может вызвать ряд изнуряющих симптомов, включая боль и отек в суставах, усталость и депрессию (фото любезно предоставлено SPL).

Генетические сигнатуры и биомаркеры предсказывают возникновение ревматоидного артрита

Ревматоидный артрит характеризуется воспалением суставов, приводящим к разрушению кости и хряща. Поскольку структурное повреждение... Читать дальше

Микробиология

посмотреть канал
HiSeq 2500 - мощная система с высокой пропускной способностью (фото любезно предоставлено Illumina).

American Gut Project сообщает о результатах работы по исследованию микробиома

Проведена большая работа, связанная с исследованием человеческого микробиома с конкретными фенотипами и переменными образа... Читать дальше

Патология

посмотреть канал
Набор для обратной транскрипции Sensiscript, использующий очень небольшое количество РНК, идеально подходит для случаев применения, требующих высокой чувствительности (фото любезно предоставлено Qiagen).

Определен новый белок-мишень для выявления рака толстой кишки

Колоректальный рак (КРР) является третьим наиболее часто диагностируемым онкологическим заболеванием и третьей ведущей причиной... Читать дальше

Лаб. технология

посмотреть канал
Гибридизация нуклеиновой кислоты на электрически реконфигурируемой сети из магнитных наночастиц с золотым покрытием позволяет обнаруживать микроРНК в крови (фото любезно предоставлено Университетом Нового Южного Уэльса).

Инструмент на основе магнитных наночастиц поможет обнаруживать микроРНК

Разработан метод на основе магнитных наночастиц для непосредственного обнаружения микроРНК в необработанных образцах цельной... Читать дальше

Индустрия

посмотреть канал
По прогнозам специалистов, глобальный рынок портативного коагулогического исследования будет расти частично благодаря растущему гериатрическому населению во всем мире (фото любезно предоставлено Shutterstock).

Глобальный рынок коагулогического исследования по месту лечения обусловлен увеличением численности гериатрического населения

По прогнозам специалистов, глобальный рынок портативного тестирования на коагуляцию будет расти с совокупными темпами годового... Читать дальше
Copyright © 2000-2018 Globetech Media. All rights reserved.