Мы используем технологию cookie для понимания того, как вы пользуетесь нашим сайтом. Под этим подразумевается персонализированный контент и реклама. Для того, чтобы узнать больше - нажмите сюда. Пользуясь данным сайтом вы подтверждаете согласие с нашей политикой. Политика cookie.
Разделы Партнеры Информация LinkXpress
Вход
Реклама на сайте
RANDOX LABORATORIES

Молекулярные тесты являются эквивалентными анализу костного мозга на множественную миелому

Редакция HospiMedica - Россия
Опубликовано 25 May 2018
Print article
HiSeq 4000 Systems использует инновационную технологию структурированных проточных ячеек для обеспечения быстрого и высокопроизводительного секвенирования (фото любезно предоставлено Illumina).
HiSeq 4000 Systems использует инновационную технологию структурированных проточных ячеек для обеспечения быстрого и высокопроизводительного секвенирования (фото любезно предоставлено Illumina).
Множественная миелома (ММ) представляет собой гематологическую злокачественную опухоль, характеризующуюся инфильтрацией костного мозга клональными плазматическими клетками, которые разнородно присутствуют во многих областях костного мозга.

Жидкие биопсии, в том числе исследование циркулирующих опухолевых клеток (ЦОК) и внеклеточной ДНК (вкДНК), позволили проводить минимально инвазивную характеризацию многих видов рака, но они редко анализируются вместе. Понимание обнаруживаемости и геномного соответствия ЦОК и вкДНК может сообщить об их использовании при управлении точной медициной для лечения опухолей.

Группа ученых, возглавляемая сотрудниками из Института раковых исследований Дана-Фарбер (Dana-Farber Cancer Institute; Бостон, штат Массачусетс, США), изучила вкДНК от 107 пациентов и ЦОК от 56 пациентов. Затем ученые сопоставили вкДНК с данными костного мозга от девяти пациентов и сравнили все три формы биопсии у четырех дополнительных пациентов. ДНК экстрагировали с использованием наборов циркулирующих нуклеиновых кислот из плазмы с объемом от 2 до 6 мл. ЦОК и клетки плазмы костного мозга были выделены с помощью отбора на частицах CD138 после центрифугирования с фиколлом цельной крови и образцов костного мозга соответственно. Для зародышевой ДНК использовали отрицательные фракции мононуклеарных клеток периферической крови.

Геномную ДНК экстрагировали с использованием набора для экстракции ДНК. Образцы были подготовлены для полногеномного секвенирования (ultra-low pass whole-genome sequencing - ULP-WGS) и до 96 библиотек были объединены и секвенированы с использованием 100 п.н. спаренных концов на дорожке 1× на HiSeq2500. Гибридный захват библиотек вкДНК был выполнен с использованием набора Illumina Nextera Rapid Capture Exome с заданными блокирующими олигонуклеотидами. Секвенирование было выполнено с использованием 100 п.н. спаренных концов на Illumina HiSeq4000 в высокопроизводительном режиме с двумя-четырьмя библиотеками на дорожку.

Исследователи сообщили об этом, используя ULP-WGS, и обнаружили, что обе опухолевые фракции коррелируют с прогрессированием заболевания. Применяя полноэкзомное секвенирование к вкДНК, ЦОК и соответствующим биопсиям опухолей, они обнаружили согласие в клональных соматических мутациях (~ 99%) и изменении числа копий (~ 81%) между жидкой биопсией и биопсией опухоли. Важно отметить, что анализ ЦОК и вкДНК вместе позволяет перекрестно проверять мутации, обнаруживать мутации, исключительные для ЦОК или вкДНК, и позволяет профилировать опухоли на основе крови у большей части пациентов. Исследование демонстрирует полезность анализа ЦОК и вкДНК вместе для выявления MM.

Медицинский онколог и старший автор исследования Ирэн Гобриал (Irene Ghobrial) сказала: "До сих пор у нас не было подходящего способа измерить, как клеточные популяции множественной миеломы развиваются от первичных стадий до диагностированных заболеваний, а затем реагируют на лечение. Теперь биопсии крови могут иметь огромное значение, расширяя наше понимание множественной миеломы и позволяя представить график того, как болезнь прогрессирует и реагирует на терапию". Исследование было опубликовано 27 апреля 2018 года в журнале Nature Communications.

Ссылки по теме:
Институт раковых исследований Дана-Фарбер


Print article

Каналы

Химия

посмотреть канал
Реагент Access AccuTnI+3 содержит парамагнитные частицы для хемилюминесцентного иммуноанализа для количественного определения уровней сердечного тропонина I (cTnI) в сыворотке и плазме человека с использованием системы иммуноанализа Access 2 Immunoassay System для оказания помощи в диагностике инфаркта миокарда (фото любезно предоставлено Beckman-Coulter).

Анализ крови предсказывает риск смерти от коронарной недостаточности

Сердечно-сосудистое (СС) заболевание связано с активацией ренин-ангиотензиновой системы (РАС) и является основной причиной... Читать дальше

Молекулярная диагностика

посмотреть канал
Пневмотахометры, используемые для измерения максимальной скорости выдоха при контроле и диагностике астмы (фото предоставлено Wikimedia Commons).

РНК-секвенирование образца со слизистой оболочки носа поможет диагностировать астму

Создана ​​панель биомаркеров из 90 генов, которая позволяет быстро и точно диагностировать астму на основе простых образцов,... Читать дальше

Иммунология

посмотреть канал
Orientia tsutsugamushi (стрелки) в культуре жидкости бронхоальвеолярного лаважа у пациента с острым респираторным дистресс-синдромом (фото любезно предоставлено Университетом Экс-Марсель).

Антитела могут быть интерпретированы после заражения болезнью цуцугамуши

Цуцугамуши (scrub typhus) представляет собой зоонозную инфекцию, вызываемую бактерией Orientia tsutsugamushi.... Читать дальше

Микробиология

посмотреть канал
Компьютерное изображение E. coli (фото любезно предоставлено Алисой Эккерт (Alissa Eckert) и Дженнифер Остхуйзен (Jennifer Oosthuizen)/Центр по контролю и профилактике заболеваний).

Обнаружена взаимосвязь группы крови с тяжестью диареи

Энтеротоксигенные бактерии кишечной палочки (Escherichia coli) ежегодно становятся виновниками миллионов случаев диареи и... Читать дальше

Патология

посмотреть канал
Гистопатология папиллярного мышечно-неинвазивного рака мочевого пузыря (фото любезно предоставлено Американской урологической ассоциацией (American Urological Association)).

Простой анализ может снизить нагрузку лечения рака мочевого пузыря

Рак мочевого пузыря – достаточно распространенное заболевание, налагающее самую высокую цену на пациента в системе здравоохранения... Читать дальше

Лаб. технология

посмотреть канал
Обнаружение вируса Зика с использованием платиновых наномоторов и мобильного телефона (фото предоставлено Женской больницей Бригама)

Тестирование с использованием мобильного телефона поможет быстро выявлять вирус Зика

Вирус Зика, который вызывает микроцефалию и другие неврологические осложнения у младенцев, чьи матери были инфицированы во... Читать дальше

Индустрия

посмотреть канал
По прогнозам специалистов, глобальный рынок товаров для ПЦР к 2025 году превысит 7,4 миллиарда долларов США (фото любезно предоставлено iStock).

Глобальный рынок ПЦР к 2025 году превысит 7 миллиардов долларов США

Глобальный рынок товаров для полимеразной цепной реакции (ПЦР) в 2017 году оценивался в 3,7 миллиарда долларов США и, согласно... Читать дальше
Copyright © 2000-2018 Globetech Media. All rights reserved.