Мы используем технологию cookie для понимания того, как вы пользуетесь нашим сайтом. Под этим подразумевается персонализированный контент и реклама. Для того, чтобы узнать больше - нажмите сюда. Пользуясь данным сайтом вы подтверждаете согласие с нашей политикой. Политика cookie.
Please note that the LabMedica website is also available in a complete English version
Разделы Партнеры Информация LinkXpress
Вход
Реклама на сайте
GLOBETECH PUBLISHING LLC

Мобильное Приложение




American Gut Project сообщает о результатах работы по исследованию микробиома

Редакция HospiMedica - Россия
Опубликовано 11 Sep 2018
Print article
HiSeq 2500 - мощная система с высокой пропускной способностью (фото любезно предоставлено Illumina).
HiSeq 2500 - мощная система с высокой пропускной способностью (фото любезно предоставлено Illumina).
Проведена большая работа, связанная с исследованием человеческого микробиома с конкретными фенотипами и переменными образа жизни, однако данные из разных проектов оказались сложными для интеграции, а степень микробного и молекулярного разнообразия в стуле человека остается неизвестной.

В ноябре 2012 года было запущено два проекта, American Gut Project (AGP) действовал в рамках сотрудничества между Earth Microbiome Project (EMP) и Human Food Project (HFP) для выявления видов микробиологического разнообразия и микробиомов в естественных условиях посредством самозаявленной группы исследователей-любителей.

Многочисленная команда международных ученых, сотрудничающих с Калифорнийским университетом в Сан-Диего (University of California, San Diego; Ла-Хойя, штат Калифорния, США), исследовала образцы стула у людей в США, Великобритании и десятках других стран. Участники прошли добровольные опросы, связанные с их рационом, образом жизни, состоянием здоровья и историей болезни, в том числе около 1800 человек приняли участие в опросе частоты потребления различных пищевых продуктов на основе картинок.

Команда использовала инструменты MiSeq или HiSeq для секвенирования областей 16S рРНК V4 в образцах, чтобы охарактеризовать их микробный состав. Они также культивировали подмножество образцов, которые были подвергнуты метагеномному шотган-секвенированию с помощью Illumina HiSeq 2500 и профилированию метаболитов с помощью высокоэффективной жидкостной хроматографии и масс-спектрометрии (ВЭЖХ-МС).

В дополнение к выраженному общему микробному разнообразию команда отметила, что различия, обнаруженные между отдельно взятым микробиомом кишечника и соседним, иногда совпадают с различиями, описанными в разных средах для EMP. Команда также смогла профилировать микробный состав кишечника у лиц с психическими расстройствами (депрессия, шизофрения, биполярное расстройство или посттравматическое стрессовое расстройство) или без, выявив микробиомы кишечника, которые сгруппированы отдельно от 125 человек, не страдающих этими заболеваниями.

Когда дело дошло до изучения диеты, ученые обнаружили связи между количеством потребляемых человеком видов растений и их микробным разнообразием кишечника, независимо от того, была ли их общая диета веганской или вегетарианской. Аналогичным образом те, кто сообщал о потреблении разнообразной растительной пищи (30 видов пищи растительного происхождения в неделю или более), были менее склонны переносить микроорганизмы с генами устойчивости к антибиотикам по сравнению с теми, кто потреблял в неделю 10 видов растений или меньше. Возможно, более неожиданным было сравнение 139 лиц, недавно принимавших антибиотики, и 117 лиц, которые не получали антибиотики в течение года или более, что выявило рост метаболомического разнообразия после использования антибиотиков, несмотря на снижение микробного разнообразия.

Доктор философии Дэниел Макдональд (Daniel McDonald), научный директор проекта American Gut Project и ведущий автор исследования, сказал: "Мы наблюдали гораздо большее микробное разнообразие, чем в предыдущих более мелких исследованиях, и это говорит о том, что если мы посмотрим на большее количество населения, то увидим больше разнообразия, что важно для определения границ человеческого микробиома". Исследование было опубликовано 15 мая 2018 года в журнале mSystems.

Ссылки по теме:
Калифорнийский университет в Сан-Диего


Print article

Каналы

Химия

посмотреть канал
Схема 3D-печатного устройства для электрофореза на микрочипе, которое достаточно чувствительно для обнаружения трех сывороточных биомаркеров, связанных с преждевременными родами (фото предоставлено Университетом Бригама Янга).

Устройство, напечатанное на 3D-принтере, определяет биомаркеры, связанные с преждевременными родами

Преждевременные роды (ПВР), определяемые как роды до 37-й недели беременности, являются одним из самых распространенных осложнений... Читать дальше

Молекулярная диагностика

посмотреть канал
Гистопатология колоректальной карциномы: пример умеренно дифференцированной аденокарциномы, показывающий сложные железистые структуры в десмопластической строме (фото любезно предоставлено Медицинской школой Дэвида Геффена при Калифорнийском университете (David Geffen School of Medicine at the University of California)).

ЦоДНК предсказывает рецидив неметастатического колоректального рака

Колоректальный рак (КРР), также известный как рак кишечника и рак толстой кишки, является развитием рака толстой кишки или... Читать дальше

Гематология

посмотреть канал
Жертвы с серьезными травмами, которые получают переливания единиц эритроцитарной массы, хранящихся в течение 22 дней или больше, могут столкнуться с повышенным риском смерти в течение 24 часов (фото любезно предоставлено службой патологии юго-западного Лондона /South West London Pathology/).

Переливание крови, бывшей длительное время на хранении, связано с неблагоприятными явлениями

Ведущей причиной смерти после тяжелой травмы является потеря крови. Жертвы с серьезными травмами, которые получают переливания... Читать дальше

Иммунология

посмотреть канал
ИФА-тест PicoAMH измеряет количество антимюллерового гормона (AMH) в крови (фото любезно предоставлено Ansh Labs).

Диагностический тест помогает определить менопаузальный статус

Менопауза - это период в жизни женщины, когда у нее прекращается менструальный цикл и она перестает быть фертильной.... Читать дальше

Патология

посмотреть канал
Лимфатический узел с почти полной заменой метастатической меланомой. Коричневый пигмент является очаговым отложением меланина (фото любезно предоставлено доктором медицины Габриэлем Капонетти (Gabriel Caponetti)).

Анализ крови определяет эффективность лечения агрессивного рака

Анализы крови, отслеживающие количество опухолевых ДНК, могут определить, насколько хорошо проходит лечение у пациентов с... Читать дальше

Лаб. технология

посмотреть канал
Схематическое изображение чипа µLAS с двумя независимыми каналами, приводимыми в действие одинаковым давлением и напряжением. Каждый канал содержит область воронки, которая функционирует для разделения и концентрации ДНК (фото любезно предоставлено Университетом Лозанны).

Генетические методы позволяют быстро диагностировать болезнь Хантингтона

Люди с болезнью Хантингтона страдают от резких движений тела и снижения умственных способностей. Состояние обычно приводит... Читать дальше

Индустрия

посмотреть канал
По прогнозам специалистов, мировой рынок диагностики in vitro будет расти в период между 2017 и 2025 годами и к концу 2025 года достигнет почти 90 миллиардов долларов США (фото любезно предоставлено iStock).

К 2025 году мировой рынок диагностики in vitro достигнет 89 миллиардов долларов США

Мировой рынок диагностики in vitro был оценен в 55,00 миллиардов долларов США в 2016 году и, согласно прогнозам, будет расти... Читать дальше
Copyright © 2000-2019 Globetech Media. All rights reserved.