Мы используем технологию cookie для понимания того, как вы пользуетесь нашим сайтом. Под этим подразумевается персонализированный контент и реклама. Для того, чтобы узнать больше - нажмите сюда. Пользуясь данным сайтом вы подтверждаете согласие с нашей политикой. Политика cookie.
Please note that the LabMedica website is also available in a complete English version
Разделы Партнеры Информация LinkXpress
Вход
Реклама на сайте
RANDOX LABORATORIES

Мобильное Приложение




Технология Sequins представлена в качестве нового внутреннего контроля для улучшения геномного анализа

Редакция HospiMedica - Россия
Опубликовано 08 Sep 2016
Print article
Sequins представляют собой маленькие фрагменты искусственной ДНК, предназначенные для добавления в качестве эталонного средства контроля к образцу ДНК во время секвенирования, которые помогут анализировать большие наборы данных, сформированные для геномного анализа. Технология основана на определении зеркальных отображений ДНК. Sequins-фрагменты по существу являются `зеркальными` отображениями естественных последовательностей ДНК. Они ведут себя как естественные последовательности ДНК, но могут быть легко узнаваемы как искусственные (фото любезно предоставлено Крисом Хэммангом (Chris Hammang), Институт медицинских исследований Гарвана).
Sequins представляют собой маленькие фрагменты искусственной ДНК, предназначенные для добавления в качестве эталонного средства контроля к образцу ДНК во время секвенирования, которые помогут анализировать большие наборы данных, сформированные для геномного анализа. Технология основана на определении зеркальных отображений ДНК. Sequins-фрагменты по существу являются `зеркальными` отображениями естественных последовательностей ДНК. Они ведут себя как естественные последовательности ДНК, но могут быть легко узнаваемы как искусственные (фото любезно предоставлено Крисом Хэммангом (Chris Hammang), Институт медицинских исследований Гарвана).
Исследователи разработали интуитивно понятную технологию под названием “Sequins” - искусственные “зеркальные” последовательности ДНК, которые отражают геном человека и могут использоваться для составления генетических карт, ориентирования и анализа сложности генома. В настоящее время технология геномного анализа человека Sequins широко доступна для исследований.

Ученые из Института медицинских исследований Гарвана (Дарлингхёрст, Сидней, штат Новый Южный Уэльс, Австралия) разработали новую технологию. “Секвенирование генома человека преобразовывает биомедицинские исследования и влияет на оказание медицинских услуг, — сказал доктор Тим Мерсер (Tim Mercer), который руководил разработкой Sequins. — И поскольку секвенирование генома все больше и больше используется, чтобы диагностировать заболевание, становится более важным, чем когда либо прежде, чтобы исследователи и врачи-клиницисты понимали точность геномных данных, которые они проверяют”.

Доктор Мерсер и его команда предложили добавлять sequins, маленькие фрагменты искусственной ДНК, к образцу ДНК пациента во время секвенирования. Эти sequins-фрагменты в дальнейшем выполняют функцию внутренних стандартов, помогая исследователям анализировать большие наборы данных, сформированные во время секвенирования генома. Технология основана на интуитивно простом принципе: на определении зеркальных отображений ДНК. “Sequins по существу являются «зеркальными» отображениями естественных последовательностей ДНК. Также, как и мы, геном имеет хиральность, и так же, как наша правая рука отличается от нашей левой руки, sequins-фрагменты отличаются от естественных последовательностей генома. Таким образом, sequins-фрагменты ведут себя точно так же, как естественные последовательности генома, но они могут быть легко узнаваемы как искусственные”, - сказал доктор Мерсер.

При добавлении к реакции секвенирования sequins-фрагменты осуществляют внутренний контроль, с помощью которого можно оценить чувствительность и точность секвенирования генома. “Целый ряд действий, сначала в лаборатории и затем на компьютере, требуется, чтобы выполнить секвенирование генома человека или генов, которые экспрессированы в различных клетках. Sequins-фрагменты находятся вместе с ДНК человека на каждом этапе: реагируя так же, как настоящая ДНК на каждом этапе, они все же безошибочно отличаются от той настоящей ДНК. Это позволяет ученому оценивать и оптимизировать эти различные этапы”.

Поскольку sequins-фрагменты добавлены к каждому отдельному образцу, они могут обеспечить оценку образца за образцом – того, что ранее не было возможно. “Sequins является первой технологией, которая позволит применять статистическое прогнозирование к каждому отдельному секвенированию генома, — сказал доктор Мерсер. — И мы ожидаем, что их использование улучшит надежность и чувствительность диагностики генетических заболеваний”.

Диагностика рака – это одна из областей, в которой использование Sequins должно привести к улучшениям. «Внедрение технологии Sequins в клинические тесты для диагностики рака повысит надежность вывода отдельных диагностических данных, уменьшая число ошибочных диагнозов и придавая врачам-клиницистам большую уверенность в выборе лучшего курса лечения для их пациента”, - сказал доктор Мерсер.

Использование Sequins также позволит напрямую сравнивать геномные данные, полученные от научно-исследовательских институтов и центров, выполняющих секвенирование, во всем мире. “Технология Sequins вводит секвенирование ДНК в качестве стандарта, применяемого в клиниках, и станет неотъемлемой платформой для геномного исследования и медицины, — сказал соавтор Джон Мэттик (John Mattick), профессор, исполнительный директор Института медицинских исследований Гарвана. — Это еще один важный шаг в продвижении миссии Института медицинских исследований Гарвана по введению использования методов геномики в клинике”.

Возможные области применения технологии Sequins многочисленны. Поскольку все геномы, от геномов бактерий до генома человека, имеют хиральность, sequins могут быть также разработаны для любого организма или любого направления практического применения секвенирования нового поколения.

Технология Sequins описана в двух взаимосвязанных исследованиях, проведенных Хардвиком С.А. (Hardwick S.A.) и соавторами и Девесоном И.В. (Deveson I.W.) и соавторами, оба были опубликованы 8 августа 2016 года в журнале Nature Methods.


Ссылки по теме:
Garvan Institute of Medical Research


Print article
BIOHIT  Healthcare OY

Каналы

Химия

посмотреть канал
Новый анализ крови гарантирует практически мгновенную постановку диагноза сердечного приступа с использованием недавно открытого биомаркера белка (фото любезно предоставлено iStock).

Разработан новый анализ крови на инфаркт миокарда

Уровень сердечного миозин-связывающего белка C (cMyC) в крови после инфаркта миокарда повышается быстрее и в большей степени,... Читать дальше

Гематология

посмотреть канал
Жертвы с серьезными травмами, которые получают переливания единиц эритроцитарной массы, хранящихся в течение 22 дней или больше, могут столкнуться с повышенным риском смерти в течение 24 часов (фото любезно предоставлено службой патологии юго-западного Лондона /South West London Pathology/).

Переливание крови, бывшей длительное время на хранении, связано с неблагоприятными явлениями

Ведущей причиной смерти после тяжелой травмы является потеря крови. Жертвы с серьезными травмами, которые получают переливания... Читать дальше

Иммунология

посмотреть канал
Уникальный наконечник для пипетки, созданный на 3D-принтере, для проведения иммуноферментных анализов (фото любезно предоставлено Университетом Коннектикута).

Новая технология 3D-печати снижает стоимость иммуноферментного анализа

Традиционный иммуноферментный анализ (ИФА) проводят на планшетах с 96 микролунками; каждая лунка работает как отдельная испытательная... Читать дальше

Микробиология

посмотреть канал
Цифровая капельная ПЦР-система QX200 (фото любезно предоставлено Bio-Rad).

Олигобациллярная лепра может быть диагностирована с помощью цифрового ПЦР-анализа

Проказа, или болезнь Хансена, является хроническим бактериальным заболеванием, вызываемым Mycobacterium leprae.... Читать дальше

Патология

посмотреть канал
Портативное устройство MasSpec Pen, которое можно подключить к масс-спектрометру для диагностики рака яичников и других видов рака (фото любезно предоставлено Техасским университетом в Остине).

Устройство Masspec Pen одобрено для быстрой диагностики рака

Рак яичников является заболеванием c чрезвычайно высокой смертностью и пятой по значимости причиной всех связанных с раком... Читать дальше

Лаб. технология

посмотреть канал
Примеры мигрирующих и немигрирующих клеток рака молочной железы MDA-MB-231, мигрирующих в приборе MAqCI (микрофлюидный анализ для количественной оценки инвазии клеток). Фото любезно предоставлено Кристофером Л. Янкаскасом (Christopher L. Yankaskas), Университет Джонса Хопкинса.

Микрофлюидное устройство для измерения подвижности клеток указывает на вероятность метастазирования опухоли молочной железы

Было показано, что новый микрофлюидный тест на подвижность клеток позволяет точно предсказать вероятность возникновения метастазов... Читать дальше

Индустрия

посмотреть канал
По прогнозам специалистов, мировой рынок диагностики in vitro будет расти в период между 2017 и 2025 годами и к концу 2025 года достигнет почти 90 миллиардов долларов США (фото любезно предоставлено iStock).

К 2025 году мировой рынок диагностики in vitro достигнет 89 миллиардов долларов США

Мировой рынок диагностики in vitro был оценен в 55,00 миллиардов долларов США в 2016 году и, согласно прогнозам, будет расти... Читать дальше
Copyright © 2000-2019 Globetech Media. All rights reserved.