Мы используем технологию cookie для понимания того, как вы пользуетесь нашим сайтом. Под этим подразумевается персонализированный контент и реклама. Для того, чтобы узнать больше - нажмите сюда. Пользуясь данным сайтом вы подтверждаете согласие с нашей политикой. Политика cookie.
Разделы Партнеры Информация LinkXpress
Вход
Реклама на сайте
ROCHE DIAGNOSTICS CORP

Молекулярные тесты являются эквивалентными анализу костного мозга на множественную миелому

Редакция HospiMedica - Россия
Опубликовано 25 May 2018
Print article
HiSeq 4000 Systems использует инновационную технологию структурированных проточных ячеек для обеспечения быстрого и высокопроизводительного секвенирования (фото любезно предоставлено Illumina).
HiSeq 4000 Systems использует инновационную технологию структурированных проточных ячеек для обеспечения быстрого и высокопроизводительного секвенирования (фото любезно предоставлено Illumina).
Множественная миелома (ММ) представляет собой гематологическую злокачественную опухоль, характеризующуюся инфильтрацией костного мозга клональными плазматическими клетками, которые разнородно присутствуют во многих областях костного мозга.

Жидкие биопсии, в том числе исследование циркулирующих опухолевых клеток (ЦОК) и внеклеточной ДНК (вкДНК), позволили проводить минимально инвазивную характеризацию многих видов рака, но они редко анализируются вместе. Понимание обнаруживаемости и геномного соответствия ЦОК и вкДНК может сообщить об их использовании при управлении точной медициной для лечения опухолей.

Группа ученых, возглавляемая сотрудниками из Института раковых исследований Дана-Фарбер (Dana-Farber Cancer Institute; Бостон, штат Массачусетс, США), изучила вкДНК от 107 пациентов и ЦОК от 56 пациентов. Затем ученые сопоставили вкДНК с данными костного мозга от девяти пациентов и сравнили все три формы биопсии у четырех дополнительных пациентов. ДНК экстрагировали с использованием наборов циркулирующих нуклеиновых кислот из плазмы с объемом от 2 до 6 мл. ЦОК и клетки плазмы костного мозга были выделены с помощью отбора на частицах CD138 после центрифугирования с фиколлом цельной крови и образцов костного мозга соответственно. Для зародышевой ДНК использовали отрицательные фракции мононуклеарных клеток периферической крови.

Геномную ДНК экстрагировали с использованием набора для экстракции ДНК. Образцы были подготовлены для полногеномного секвенирования (ultra-low pass whole-genome sequencing - ULP-WGS) и до 96 библиотек были объединены и секвенированы с использованием 100 п.н. спаренных концов на дорожке 1× на HiSeq2500. Гибридный захват библиотек вкДНК был выполнен с использованием набора Illumina Nextera Rapid Capture Exome с заданными блокирующими олигонуклеотидами. Секвенирование было выполнено с использованием 100 п.н. спаренных концов на Illumina HiSeq4000 в высокопроизводительном режиме с двумя-четырьмя библиотеками на дорожку.

Исследователи сообщили об этом, используя ULP-WGS, и обнаружили, что обе опухолевые фракции коррелируют с прогрессированием заболевания. Применяя полноэкзомное секвенирование к вкДНК, ЦОК и соответствующим биопсиям опухолей, они обнаружили согласие в клональных соматических мутациях (~ 99%) и изменении числа копий (~ 81%) между жидкой биопсией и биопсией опухоли. Важно отметить, что анализ ЦОК и вкДНК вместе позволяет перекрестно проверять мутации, обнаруживать мутации, исключительные для ЦОК или вкДНК, и позволяет профилировать опухоли на основе крови у большей части пациентов. Исследование демонстрирует полезность анализа ЦОК и вкДНК вместе для выявления MM.

Медицинский онколог и старший автор исследования Ирэн Гобриал (Irene Ghobrial) сказала: "До сих пор у нас не было подходящего способа измерить, как клеточные популяции множественной миеломы развиваются от первичных стадий до диагностированных заболеваний, а затем реагируют на лечение. Теперь биопсии крови могут иметь огромное значение, расширяя наше понимание множественной миеломы и позволяя представить график того, как болезнь прогрессирует и реагирует на терапию". Исследование было опубликовано 27 апреля 2018 года в журнале Nature Communications.

Ссылки по теме:
Институт раковых исследований Дана-Фарбер


Print article

Каналы

Химия

посмотреть канал
Новое исследование показывает, что ожирение, которое влияет на печень, может сыграть определенную роль в развитии болезни Альцгеймера и деменции в отдаленном будущем (фото предоставлено Deposit Photos).

На риск развития болезни Альцгеймера влияет состояние печени и диета

Сниженные уровни плазмалогенов имеют связь с повышенным риском болезни Альцгеймера. Плазмалогены вырабатываются в печени... Читать дальше

Молекулярная диагностика

посмотреть канал
Тромбоз глубоких вен (фото предоставлено Wikimedia Commons).

Предложен быстрый метод диагностирования тромбоза глубоких вен

Простой анализ крови был предложен в качестве альтернативы довольно дорогостоящей и интенсивной ультразвуковой процедуре... Читать дальше

Иммунология

посмотреть канал
Принцип действия недорогой платформы Seq-Well для секвенирования РНК одиночных клеток (фото любезно предоставлено Shalek Lab).

Анализ полипов носовой полости позволяет сделать предположение о механизмах воспаления

Аллергическое воспаление может развиваться от устойчивой активации иммунитета 2-го типа в верхних дыхательных путях, что... Читать дальше

Микробиология

посмотреть канал
Флуоресцентный проточный цитометр-анализатор мочи UF-5000 (фото любезно предоставлено Sysmex).

Анализаторы флуоресценции оценены на диагностику инфекции мочевых путей

Инфекции мочевых путей (ИМП) являются одними из наиболее частых инфекций как у госпитализированных, так и у амбулаторных больных.... Читать дальше

Патология

посмотреть канал
Набор ELISA для определения концентрации молекулы повреждения почек-1 (Kim1). Фото предоставлено Enzo Life Sciences.

Анализ крови поможет раньше выявлять рак почки

Почечно-клеточный рак (ПКР) можно вылечить с помощью хирургического вмешательства, если заболевание будет диагностировано... Читать дальше

Лаб. технология

посмотреть канал
Одна капля крови позволит TBIcheck провести диагностику возможной лёгкой черепно-мозговой травмы. Если линия появляется ниже контрольной линии, пострадавшему необходимо посетить больницу для прохождения компьютерной томографии (фото любезно предоставлено Женевским университетом).

Портативное устройство поможет диагностировать лёгкую травму головного мозга

В Европе каждый год три миллиона человек попадают в больницы из-за подозрения на лёгкую черепно-мозговую травму (mild traumatic... Читать дальше

Индустрия

посмотреть канал
Ожидается, что к 2028 году рынок процессоров вестерн-блоттинга вырастет с 200 до 329 миллионов долларов США (фото любезно предоставлено Next Advance).

Рынок процессоров вестерн-блоттинга достигнет 329 млн долларов США к 2028 году

По прогнозам специалистов, рынок процессоров вестерн-блоттинга вырастет с совокупными темпами годового роста на уровне 5,1%,... Читать дальше
Copyright © 2000-2018 Globetech Media. All rights reserved.