Мы используем технологию cookie для понимания того, как вы пользуетесь нашим сайтом. Под этим подразумевается персонализированный контент и реклама. Для того, чтобы узнать больше - нажмите сюда. Пользуясь данным сайтом вы подтверждаете согласие с нашей политикой. Политика cookie.
Разделы Партнеры Информация LinkXpress
Вход
Реклама на сайте
GLOBETECH PUBLISHING LLC

Молекулярные тесты являются эквивалентными анализу костного мозга на множественную миелому

Редакция HospiMedica - Россия
Опубликовано 25 May 2018
Print article
HiSeq 4000 Systems использует инновационную технологию структурированных проточных ячеек для обеспечения быстрого и высокопроизводительного секвенирования (фото любезно предоставлено Illumina).
HiSeq 4000 Systems использует инновационную технологию структурированных проточных ячеек для обеспечения быстрого и высокопроизводительного секвенирования (фото любезно предоставлено Illumina).
Множественная миелома (ММ) представляет собой гематологическую злокачественную опухоль, характеризующуюся инфильтрацией костного мозга клональными плазматическими клетками, которые разнородно присутствуют во многих областях костного мозга.

Жидкие биопсии, в том числе исследование циркулирующих опухолевых клеток (ЦОК) и внеклеточной ДНК (вкДНК), позволили проводить минимально инвазивную характеризацию многих видов рака, но они редко анализируются вместе. Понимание обнаруживаемости и геномного соответствия ЦОК и вкДНК может сообщить об их использовании при управлении точной медициной для лечения опухолей.

Группа ученых, возглавляемая сотрудниками из Института раковых исследований Дана-Фарбер (Dana-Farber Cancer Institute; Бостон, штат Массачусетс, США), изучила вкДНК от 107 пациентов и ЦОК от 56 пациентов. Затем ученые сопоставили вкДНК с данными костного мозга от девяти пациентов и сравнили все три формы биопсии у четырех дополнительных пациентов. ДНК экстрагировали с использованием наборов циркулирующих нуклеиновых кислот из плазмы с объемом от 2 до 6 мл. ЦОК и клетки плазмы костного мозга были выделены с помощью отбора на частицах CD138 после центрифугирования с фиколлом цельной крови и образцов костного мозга соответственно. Для зародышевой ДНК использовали отрицательные фракции мононуклеарных клеток периферической крови.

Геномную ДНК экстрагировали с использованием набора для экстракции ДНК. Образцы были подготовлены для полногеномного секвенирования (ultra-low pass whole-genome sequencing - ULP-WGS) и до 96 библиотек были объединены и секвенированы с использованием 100 п.н. спаренных концов на дорожке 1× на HiSeq2500. Гибридный захват библиотек вкДНК был выполнен с использованием набора Illumina Nextera Rapid Capture Exome с заданными блокирующими олигонуклеотидами. Секвенирование было выполнено с использованием 100 п.н. спаренных концов на Illumina HiSeq4000 в высокопроизводительном режиме с двумя-четырьмя библиотеками на дорожку.

Исследователи сообщили об этом, используя ULP-WGS, и обнаружили, что обе опухолевые фракции коррелируют с прогрессированием заболевания. Применяя полноэкзомное секвенирование к вкДНК, ЦОК и соответствующим биопсиям опухолей, они обнаружили согласие в клональных соматических мутациях (~ 99%) и изменении числа копий (~ 81%) между жидкой биопсией и биопсией опухоли. Важно отметить, что анализ ЦОК и вкДНК вместе позволяет перекрестно проверять мутации, обнаруживать мутации, исключительные для ЦОК или вкДНК, и позволяет профилировать опухоли на основе крови у большей части пациентов. Исследование демонстрирует полезность анализа ЦОК и вкДНК вместе для выявления MM.

Медицинский онколог и старший автор исследования Ирэн Гобриал (Irene Ghobrial) сказала: "До сих пор у нас не было подходящего способа измерить, как клеточные популяции множественной миеломы развиваются от первичных стадий до диагностированных заболеваний, а затем реагируют на лечение. Теперь биопсии крови могут иметь огромное значение, расширяя наше понимание множественной миеломы и позволяя представить график того, как болезнь прогрессирует и реагирует на терапию". Исследование было опубликовано 27 апреля 2018 года в журнале Nature Communications.

Ссылки по теме:
Институт раковых исследований Дана-Фарбер


Print article

Каналы

Химия

посмотреть канал
Более высокие уровни воспалительного биомаркера растворимого рецептора-1  фактора некроза опухоли (sTNFR-1) связаны с ухудшением функции почек у здоровых взрослых людей (фото любезно предоставлено Enbrel).

Уровни воспалительного маркера связаны с ухудшением функции почек

Рецептор-1 фактора некроза опухоли (TNFR-1), который играет важную роль в дисфункции эндотелиальных клеток и воспалении,... Читать дальше

Молекулярная диагностика

посмотреть канал
Идентифицирована рекомбинация генов в нейронах, которая продуцирует тысячи новых вариантов генов в мозге человека с болезнью Альцгеймера (фото любезно предоставлено Институтом медицинских открытий Сенфорд Бернам Пребис).

Рекомбинация ДНК в головном мозге связана с болезнью Альцгеймера

Болезнь Альцгеймера представляет собой кризисную ситуацию для общественного здравоохранения. Причина этого заболевания остается... Читать дальше

Иммунология

посмотреть канал
Система IMMULITE 1000 – небольшой настольный иммунологический анализатор (фото предоставлено Siemens Healthcare Diagnostics).

Уровни IgA-нефропатии связаны с тяжестью заболевания

IgA- нефропатия (IgAN) является наиболее распространенной причиной первичного гломерулонефрита. IgAN может предопределять... Читать дальше

Микробиология

посмотреть канал
Набор Loopamp Malaria Pan Detection Kit - это качественный тест на обнаружение возбудителей малярии (Plasmodium ovale, P. vivax, P. malariae и P. falciparum) в образцах крови человека (фото любезно предоставлено Human Diagnostics Worldwide).

Комбинированные ДНК-технологии проанализированы на диагностику малярии

Малярия является одним из наиболее важных паразитарных инфекционных заболеваний, риску заражения которыми подвержена почти... Читать дальше

Патология

посмотреть канал
Принцип выявления рака с помощью теста IvyGene на основе анализа метилирования, использующего жидкую биопсию (фото предоставлено доктором Кевином Коннерсом).

Тест на основе анализа метилирования с использованием жидкой биопсии помогает обнаружить рак печени

Гепатоцеллюлярная карцинома (ГЦК) составляет около 75% случаев рака печени в США и имеет общепризнанные критерии скрининга.... Читать дальше

Лаб. технология

посмотреть канал
Cap-Score обнаруживает и анализирует картины локализации с использованием флуоресцентной микроскопии, чтобы отличить способных к зачатию сперматозоидов от не способных (фото любезно предоставлено Androvia LifeSciences).

Созданы тесты, показывающие уровень мужской репродуктивной способности

Мужская фертильность является серьезной проблемой, вызывающей беспокойство во всем мире. Тем не менее область андрологии... Читать дальше

Индустрия

посмотреть канал
Ожидается, что глобальный рынок анализаторов гемостаза/коагуляции к 2026 году вырастет до 9,55 миллиардов долларов США, что обусловлено большей частью ростом числа заболеваний крови (фото любезно предоставлено Analyticon Biotechnologies.

Глобальный рынок анализаторов гемостаза/коагуляции достигнет 9,5 миллиардов долларов США к 2026 году

В 2017 году глобальный рынок анализаторов гемостаза/коагуляции оценивался в 3,65 миллиардов долларов США, и ожидается, что... Читать дальше
Copyright © 2000-2018 Globetech Media. All rights reserved.